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NBDC ヒトデータベース

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現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

DRA007411

データの種類
NGS(Target Capture)
アクセス制限
非制限公開
総データ量
70.9 GB
ファイル形式
  • FASTQ
研究
hum0114
公開日
2019-01-28
更新日
2019-01-23

解析手法

Targeted DNA sequencing

材料と対象者
日本人細胞株(JBIC細胞株):560検体
  • 対象者数
    560 (検体数)
  • 対象集団
    日本人
試料説明
日本人細胞株から抽出したDNA
実験方法
Targeted DNA sequencing
測定対象
HLA領域
(HLA-A, -B, -C, -DMA, -DMB, -DOA, -DOB, -DPA1, -DPB1, -DQA1, -DQB1, -DRA, -DRB1, -DRB2, -DRB3, -DRB4, -DRB5, -DRB6, -DRB7, -DRB8, -DRB9, -E, -F, -G, -H, -J, -L, -V, MICA, MICB, TAP1, TAP2)
試薬キット
KAPA HyperPlus Kit
SeqCap EZ Choice
断片化
酵素反応
プラットフォーム
Illumina MiSeq
リードタイプ
ペアエンド
リード長
602 bp