データセット ID
DRA007411
- データの種類
- NGS(Target Capture)
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 70.9 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0114
- 公開日
- 2019-01-28
- 更新日
- 2019-01-23
- DDBJ Search
- DRA007411 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 日本人細胞株(JBIC細胞株):560検体
- 対象者数560 (検体数)
- 対象集団日本人
- 試料説明
- 日本人細胞株から抽出したDNA
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- HLA領域
(HLA-A, -B, -C, -DMA, -DMB, -DOA, -DOB, -DPA1, -DPB1, -DQA1, -DQB1, -DRA, -DRB1, -DRB2, -DRB3, -DRB4, -DRB5, -DRB6, -DRB7, -DRB8, -DRB9, -E, -F, -G, -H, -J, -L, -V, MICA, MICB, TAP1, TAP2) - 試薬キット
- KAPA HyperPlus Kit
SeqCap EZ Choice - 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina MiSeq
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 602 bp