hum0099 のリリース情報
hum0099-v1
2017-04-24- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 健常者105名（男性21名、女性84名）の末梢血単核細胞から5種類の免疫細胞（CD4陽性T細胞、CD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、単球）を単離し、各細胞からtotal RNAを抽出した。また、全血からDNAとtotal RNAを抽出した。
DNAに対しては、Infinium OmniExpressExome BeadChips（Illumina）を用いたgenotypingを実施し、total RNAに対しては、TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kits（Illumina）を用いてRNA-seqのライブラリーを作成後、HiSeq 2500により平均長125bpを読んだ（paired-end）。
RNA-seqの結果は制限公開データとして個別検体の遺伝子毎の発現量をFPKM値として提供する（txt）。また、SNPアレイ情報については非制限公開データとして統計解析結果を提供する（txt）。