研究 ID
hum0099-v1リリース情報
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研究題目
ヒト免疫細胞における遺伝子多型と遺伝子発現の関連解析
研究概要
- 目的
- ヒト免疫細胞における遺伝子多型と遺伝子発現の関連解析
- 研究方法
- 5種類の免疫細胞（CD4陽性T細胞、CD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、単球）からtotal RNAを、全血からgenomic DNAとtotal RNAを精製し、genotypingおよびRNA-seqを実施した。
- 対象
- 日本人健常者 105名（男性21名、女性84名）、1名につき6 サンプル（5種類の免疫細胞+全血）
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000085 | RNA-seqによる遺伝子発現量データ（FPKM情報） |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| NHA000051 | eQTL解析の結果：各varinatの対象遺伝子に対する統計量（effect size, P-value等）のまとめ |
| 非制限公開 | 2017-04-24 |
提供者
- 研究代表者
- 山本 一彦
- 所属機関
- 東京大学大学院 医学系研究科 アレルギー・リウマチ内科
- 研究代表者
- 久保 充明
- 所属機関
- 理化学研究所 統合生命医科学研究センター 疾患多様性医科学研究部門
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
武田薬品工業株式会社との共同研究 | eQTLを基礎とした創薬標的の探索と治療法の開発 | N/A |
関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Polygenic burdens on cell-specific pathways underlie the risk of rheumatoid arthritis |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Kyuyoung Song | Biochemistry and Molecular Biology, University of Ulsan college of medicine | 韓国 | Analysis of genome-wide association screening data for the identification of genes associated with inflammatory bowel disease in Koreans | 2018-08-06 – 2019-09-24 | |
| 浜田 道昭 | 浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05 – 2027-10-31 | |
| 高地 雄太 | 難治疾患研究所ゲノム機能多様性分野, 東京医科歯科大学 | 日本 | 機能性遺伝子多型の網羅的解析を介した多因子疾患の病態解明 | 2023-04-12 – 2028-03-31 |