データセット ID
NHA000051
- データの種類
- eQTL解析の結果：各varinatの対象遺伝子に対する統計量（effect size, P-value等）のまとめ
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 1.8 GB
- ファイル形式
- ZIP
- 研究
- hum0099
- 公開日
- 2017-04-24
- 更新日
- 2017-04-24
- Secondary ID
- hum0099.v1.eqtl.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0099.v1.eqtl.v1.zip | 1.8 GB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- 健常者：105名（男性21名、女性84名）
- 健康状態健常
- 対象者数105 (人数)
- 性別混在
- 試料説明
- 全血より抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- HumanOmniExpressExome BeadChip Kit
- プラットフォーム
- Illumina HumanOmniExpressExome
- 参照ゲノム
- GRCh37
- QC・フィルタリング
- MAF≥0.05, average maximum posterior probability ≥ 0.9, INFO ≥ 0.4 (5,600,101 variants)
- インピュテーション
- IMPUTE2 + 1000 Genomes Phase 1 v3
- 解析方法
- GenCall software（GenomeStudio）
- バリアント数
- 563,436 SNPs
- 加工データの種類
- 変異コール