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NBDC ヒトデータベース
NBDC Research ID:hum0074-v2
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研究題目

テーラーメイド治療を目指した肝炎ウイルスデータベース構築に関する研究

研究概要

目的: テーラーメイド医療を目指した肝炎ウイルスデータベース構築

研究方法: 対象1〜3について、Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0を使用して約90万個の一塩基多型 (Single Nucleotide Polymorphisms: SNPs) の遺伝子型を決定後、ゲノムワイド関連解析 (Genome-Wide Association Study: GWAS) を実施 対象4について、Affymetrix Axiom Genome-Wide ASI 1 Array Plateを使用して約60万個のSNPsの遺伝子型を決定後、GWASを実施

対象: 1. PEG-IFN/RBVの治療応答性 (血中C型肝炎ウイルス排除の有無) C型肝炎ウイルスRNAの陰性化が得られない群 (null virological response［NVR］) : 78症例 C型肝炎ウイルスRNAの持続陰性を示す群 (sustained virological response［SVR］) : 51症例 C型肝炎ウイルス応答群 (virological response［VR］) 一時的にでも陰性化した群 (SVR + transient virologic response［TVR］群) : 64症例 2. C型肝炎PEG-IFN/RBV併用療法による血小板減少 血小板減少＋: 107症例 血小板減少－: 196症例 3. 進展に伴うヘモグロビン減少 ヘモグロビン減少＋: 94症例 ヘモグロビン減少－: 209症例 4. インターフェロン治療によるC型肝炎ウイルス排除 (sustained virological response: SVR) 後の肝発がん 治療終了後1年以上経過して肝がんを発症した群: 123症例 治療終了後5年以上経過して肝がんを発症していない群: 333症例

データセット一覧

データセット ID
アクセス制限
データの種類
公開日
hum0074.v1.vr.v1非制限公開NVR 78症例、SVR 51症例、VR 64症例のGWAS2018-02-27
hum0074.v1.plt.v1非制限公開C型肝炎PEG-IFN/RBV併用療法による 血小板減少＋ 94症例および 血小板減少－ 196症例のGWAS2018-02-27
hum0074.v1.Hb.v1非制限公開進展に伴うヘモグロビン減少＋ 94症例および ヘモグロビン減少－ 209症例のGWAS2018-02-27
hum0074.v2.hcc.v1非制限公開SVR後肝がん発症 123症例および 肝がんを発症していない 333症例のGWAS2018-09-25

提供者情報

    研究代表者
    田中 靖人
    所属機関
    熊本大学大学院 生命科学研究部 消化器内科学

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名
URL
データなし

助成金情報

科研費・助成金名
タイトル
研究課題番号
厚生労働科学研究費補助金テーラーメイド治療を目指した肝炎ウイルスデーターベース構築に関する研究
  • H19-kanen-013
厚生労働科学研究費補助金ウイルス性肝炎に対する応答性を規定する宿主因子も含めた情報のデータベース構築・治療応用に関する研究
  • H22-kanen-005
厚生労働科学研究費補助金肝炎の新規診断法や新規治療法を開発するためのゲノムワイド関連解析の手法を用いた宿主因子の解析に関する研究
  • JP15fk0210018
日本医療研究開発機構 (AMED) 肝炎等克服緊急対策研究事業Ｃ型肝炎の新たな治療関連因子及び治癒後の病態進展・改善に関連する宿主因子等の同定を目指したゲノムワイド研究
  • JP18fk0210001

関連論文

タイトル
DOI
データセット
Genome-wide Association Study Identifies TLL1 Variant Associated With Development of Hepatocellular Carcinoma After Eradication of Hepatitis C Virus Infectionhttps://doi.org/10.1053/j.gastro.2017.01.041
Genome-wide association of IL28B with response to pegylated interferon-α and ribavirin therapy for chronic hepatitis Chttps://doi.org/10.1038/ng.449
Genome-wide association study identified ITPA/DDRGK1 variants reflecting thrombocytopenia in pegylated interferon and ribavirin therapy for chronic hepatitis Chttps://doi.org/10.1093/hmg/ddr249

制限公開データの利用者一覧

研究代表者
所属機関
国・州名
研究題目
データ利用期間
利用データID
データなし