データセット ID
NHA000063
- データの種類
- C型肝炎PEG-IFN/RBV併用療法による
血小板減少＋ 94症例および
血小板減少- 196症例のGWAS - アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 21.2 KB
- ファイル形式
- CSV
- XLSX
- 研究
- hum0074
- 公開日
- 2018-02-27
- 更新日
- 2018-02-27
- Secondary ID
- hum0074.v1.plt.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0074.v1.plt.v1.csv | 8.8 KB | ||
| hum0074.v1_ | Dictionary file | 12.4 KB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- C型肝炎PEG-IFN/RBV併用療法による血小板減少
血小板減少有：107症例
血小板減少無：196症例 - 健康状態罹患
- 対象者数303 (人数)
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Genome-Wide Human SNP Array 6.0 Kit
- プラットフォーム
- Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0
- 参照ゲノム
- NCBI36
- QC・フィルタリング
- Sample call rate < 0.95、SNP call rate < 0.95、
HWE P < 0.001、Chi-square test (allelic model) P < 1 x 10^-4 - 解析方法
- Birdseed version 3
- バリアント数
- 66 SNPs