研究 ID
hum0056-v1リリース情報
最新
研究題目
ヒト全ゲノム解析に基づく高精度の住民ゲノム参照パネルと3層オミックスパネルの作成
研究概要
- 目的
- いわて東北メディカル・メガバンク機構（IMM）が実施した多層オミックス参照パネルを研究コミュニティに提供すること。
- 研究方法
- 東北メディカル・メガバンク計画地域住民コホート参加者197名のバフィーコートもしくは末梢血より単離した単球、CD4陽性Tリンパ球、好中球を対象に、次世代シークエンサーによる全ゲノムシークエンス（Whole Genome Sequencing: WGS）、全ゲノムバイサルファイトシークエンス（Whole Genome Bisulfite Sequencing: WGBS）およびRNA シークエンス（RNA Sequencing: RNA-seq）を実施した。197名のSNPsのアリル頻度情報、CpG部位のメチル化率情報、各転写物のFPKM値情報を提供する。
- 対象
- IMM地域住民コホート102名の単球、102名のCD4陽性Tリンパ球、94名の好中球（計：197名）
データセット
提供者
- 研究代表者
- 清水 厚志
- 所属機関
- 岩手医科大学 災害復興事業本部
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
いわて東北メディカル・メガバンク機構 (http://iwate-megabank.org/) /生体情報解析部門 | N/A |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
日本医療研究開発機構 医療研究開発推進事業費補助金 | 東北メディカル・メガバンク計画（岩手医科大学）東日本大震災復興特別会計分 |
|
文部科学省 次世代医療研究開発拠点形成事業費補助金 | 東北メディカルメガバンク計画 | N/A |
関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Genome-wide identification of inter-individually variable DNA methylation sites improves the efficacy of epigenetic association studies | N/A |