研究 ID
hum0053-v2リリース情報
最新
研究題目
悪性中皮腫のプロファイリングによる新規分子標的の同定
研究概要
- 目的
- アスベスト曝露によって発症する悪性胸膜中皮腫の網羅的ゲノム解析により新規分子標的治療法候補分子の同定を行うとともに、新たな分子診断・治療法の開発を目指す
- 研究方法
- Whome Exome Sequencing（Exome）：悪性胸膜中皮腫患者の外科手術検体あるいは樹立した中皮腫細胞株、および、同一症例の末梢血より抽出したゲノムDNAを用いて全エクソームシークエンス解析を行った。
Whole Genome Sequencing（WGS）：悪性胸膜中皮腫患者の外科手術検体（腫瘍組織）より樹立した中皮腫細胞株より抽出したDNAを対象としたWGS解析を、large structral variantsを同定するために10X Chromiumを用いて行った。 - 対象
- 悪性胸膜中皮腫38症例 （患者由来中皮腫細胞株12例を含む）
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000062 | NGS（Exome） |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000256 | NGS（WGS） |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 |
提供者
- 研究代表者
- 中野 孝司
- 所属機関
- 兵庫医科大学 呼吸器内科
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム（P-DIRECT） | 分子プロファイリングによる新規標的同定を通じた難治がん治療法開発（悪性中皮腫のプロファイリングによる新規分子標的の同定） |
|
日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE） | 悪性中皮腫のゲノム異常と代謝・細胞特性の包括的理解による新規分子標的の同定 |
|
関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Integrative molecular characterization of malignant pleural mesothelioma. |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 白石 航也 | ゲノム生物学研究分野, 国立研究開発法人国立がん研究センター研究所 | 日本 | ゲノム解析に基づく宿主並びに腫瘍における免疫応答ネットワーク機構の解明 | 2019-08-05 – 2029-03-31 | |
| 有田 正規 | 生命情報・DDBJ センター, 国立遺伝学研究所 | 日本 | DDBJ センターと NBDC による JGA 解析データの提供 | 2021-10-07 – 2030-03-31 |