hum0053 のリリース情報
hum0053-v2
2020-04-14- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 日本人の悪性胸膜中皮腫患者の外科手術検体から樹立した中皮腫細胞株より抽出したゲノムDNAを用いた10x Genomics Chromium ControllerによるLong Read Whole Genome Sequencingデータ（fastq）およびサンプルごとのStructural Variantsデータ（vcf, bed）を提供する。
hum0053-v1
2016-07-20- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 日本人の悪性胸膜中皮腫患者の外科手術検体あるいは樹立した中皮腫細胞株より抽出したゲノムDNA、および、末梢血から抽出したDNAを用いた全Exome解析の結果をbamファイルにて提供する。
SureSelect All Exon kitによりExon領域を濃縮したライブラリーを作成し、Illumina HiSeq 2000/2500にて約250-350 bpの断片をPair-end法によりシーケンスを行った。得られたfastqファイルをBWA、NovoAlignにてヒト参照配列hg19にマッピングし、bamファイルを得た。