データセット ID
JGAD000062
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 640 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0053
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000062 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000062 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 悪性胸膜中皮腫：38症例（腫瘍組織および非腫瘍組織ペア：76検体）
- 健康状態罹患
- 対象者数38 (人数)
- 試料説明
- 悪性胸膜中皮腫患者の外科手術検体あるいは樹立した中皮腫細胞株より抽出したDNA（腫瘍組織）
同一症例の末梢血から抽出したDNA（非腫瘍組織） - 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 細胞株
- Mesothelioma cell line
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V4
SureSelect Human All Exon V5 + lincRNA - 断片化
- 超音波断片化（Covaris E220）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
Illumina HiSeq 2500 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- 表現型データの有無
- あり