現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0574-v1リリース情報

最新

研究題目

悪性腫瘍におけるゲノム解析データベース構築に関する研究

研究概要

目的: 悪性腫瘍における包括的なゲノム解析データベースを構築し、悪性腫瘍の病態を多角的に解析することにより、ゲノム情報と臨床経過との関連の解明、人工知能を用いた診断技術の開発、新規治療の開発を行うこと。
研究方法: 新鮮凍結組織からRNeasy Plus Universal Mini Kitを用いて抽出したtotal RNAを対象としたRNA sequencing、FFPE 組織および新鮮凍結組織から、それぞれMaxwell RSC DNA FFPE KitおよびMaxwell RSC Tissue DNA Kit（Promega, Madison, WI, USA）を用いて抽出したDNAを対象とした全エクソームシークエンス
対象: 直腸がん：2症例（POLE変異陽性直腸がんとPOLE変異陰性直腸がん）、BRCA1/2のgermline病的バリアントを有する胃腺がん：4例
URL: N/A

データセット

カート	データセット ID	データの種類	解析手法	アクセス制限	公開日
	JGAD001063	NGS（RNA-seq）	RNA-seq	制限公開（Type I）	2026-07-27
	JGAD001064	NGS（Exome）	WES	制限公開（Type I）	2026-07-27

提供者

研究代表者: 島田能史
所属機関: 新潟大学大学院医歯学総合研究科消化器・一般外科学

研究代表者: 市川寛
所属機関: 新潟大学大学院医歯学総合研究科消化器・一般外科学

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

科研費・助成金名	研究課題名	研究課題番号
科学研究費助成事業基盤研究（C）	直腸癌の化学放射線療法の治療効果に関わる免疫応答の変化に着目した分子機構の解明	25K11923
科学研究費助成事業基盤研究（C）	胚細胞性相同組換え修復遺伝子異常を伴う胃癌の分子生物学的特徴と臨床転帰の解明	25K12021

関連論文

関連論文はありません。

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