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NBDC ヒトデータベース
NBDC Research ID:hum0574-v1
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研究題目

悪性腫瘍におけるゲノム解析データベース構築に関する研究

研究概要

目的: 悪性腫瘍における包括的なゲノム解析データベースを構築し、悪性腫瘍の病態を多角的に解析することにより、ゲノム情報と臨床経過との関連の解明、人工知能を用いた診断技術の開発、新規治療の開発を行うこと。

研究方法: 新鮮凍結組織からRNeasy Plus Universal Mini Kitを用いて抽出したtotal RNAを対象としたRNA sequencing、FFPE 組織および新鮮凍結組織から、それぞれMaxwell RSC DNA FFPE KitおよびMaxwell RSC Tissue DNA Kit(Promega, Madison, WI, USA)を用いて抽出したDNAを対象とした全エクソームシークエンス

対象: 直腸がん:2症例(POLE変異陽性直腸がんとPOLE変異陰性直腸がん)、BRCA1/2のgermline病的バリアントを有する胃腺がん:4例

データセット一覧

データセット ID
アクセス制限
データの種類
公開日
JGAD001063制限公開(Type I)NGS(RNA-seq)2026-07-27
JGAD001064制限公開(Type I)NGS(Exome)2026-07-27

提供者情報

    研究代表者
    島田 能史
    所属機関
    新潟大学大学院医歯学総合研究科 消化器・一般外科学
    研究代表者
    市川 寛
    所属機関
    新潟大学大学院医歯学総合研究科 消化器・一般外科学

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名
URL
データなし

助成金情報

科研費・助成金名
タイトル
研究課題番号
科学研究費助成事業 基盤研究(C)直腸癌の化学放射線療法の治療効果に関わる免疫応答の変化に着目した分子機構の解明
  • 25K11923
科学研究費助成事業 基盤研究(C)胚細胞性相同組換え修復遺伝子異常を伴う胃癌の分子生物学的特徴と臨床転帰の解明
  • 25K12021

関連論文

タイトル
DOI
データセット
データなし

制限公開データの利用者一覧

研究代表者
所属機関
国・州名
研究題目
データ利用期間
利用データID
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