研究 ID
hum0574-v2リリース情報
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研究題目
悪性腫瘍におけるゲノム解析データベース構築に関する研究
研究概要
- 目的
- 悪性腫瘍における包括的なゲノム解析データベースを構築し、悪性腫瘍の病態を多角的に解析することにより、ゲノム情報と臨床経過との関連の解明、人工知能を用いた診断技術の開発、新規治療の開発を行うこと。
- 研究方法
- 新鮮凍結組織からRNeasy Plus Universal Mini Kitを用いて抽出したtotal RNAを対象としたRNA sequencing、FFPE 組織および新鮮凍結組織から、それぞれMaxwell RSC DNA FFPE KitおよびMaxwell RSC Tissue DNA Kitを用いて抽出したDNAを対象とした全エクソームシークエンス、新鮮凍結組織からMaxwell 16 LEV Blood DNA Kitを用いて抽出したDNAを対象とした全ゲノムシークエンス
- 対象
- 直腸がん：2症例（POLE変異陽性直腸がんとPOLE変異陰性直腸がん）、BRCA1/2のgermline病的バリアントを有する胃腺がん：4症例、
根治的外科切除を施行された大腸がん：32症例 - URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD001063 | NGS（RNA-seq） |
| 制限公開（Type I） | 2026-07-27 | |
| JGAD001064 | NGS（Exome） |
| 制限公開（Type I） | 2026-07-27 | |
| JGAD001079 | NGS（WGS） |
| 制限公開（Type I） | 2026-11-06 |
提供者
- 研究代表者
- 島田 能史
- 所属機関
- 新潟大学大学院医歯学総合研究科 消化器・一般外科学
- 研究代表者
- 市川 寛
- 所属機関
- 新潟大学大学院医歯学総合研究科 消化器・一般外科学
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 直腸癌の化学放射線療法の治療効果に関わる免疫応答の変化に着目した分子機構の解明 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 胚細胞性相同組換え修復遺伝子異常を伴う胃癌の分子生物学的特徴と臨床転帰の解明 |
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デンカ株式会社研究助成金 | 日本人患者の癌遺伝子変異と治療法適合性に関する研究 |
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デンカ株式会社研究助成金 | 日本人患者の癌遺伝子変異と治療法適合性に関する実用化研究 |
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デンカ株式会社研究助成金 | 日本人患者の癌遺伝子変異と治療法適合性に関する実用化研究‐癌遺伝子変異検査におけるゲノムデータの管理方法の検討‐ |
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デンカ株式会社研究助成金 | 癌の治療標的遺伝子診断における次世代シークエンサーを用いた遺伝子変異検査（CANCERPLEX-JP®435遺伝子パネル）臨床性能評価試験 |
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新潟県研究助成金 | 次世代シークエンサーを用いた癌ゲノム医療システム基盤構築に関する研究 |
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関連論文
関連論文はありません。
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