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NBDC ヒトデータベース
JGAD001064
公開日
2026-07-27

更新日
2026-07-27

研究
hum0574

データの種類
NGS(Exome)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000920

解析手法

WES

材料と対象者

BRCA1/2のgermline病的バリアントを有する胃腺がん (ICD10: C16.9) : 4症例 計8検体
      Patient 1: 肝転移巣 (腫瘍) ならびに正常肝 (非腫瘍) の新鮮凍結組織
      Patient 2-4: 原発巣 (腫瘍) ならびに正常リンパ節 (非腫瘍) の FFPE検体

実験方法

WES

プラットフォーム

Illumina [NovaSeq 6000]

試料説明

腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA

ライブラリ構築

SureSelect Human All Exon V6

断片化

超音波断片化

リードタイプ

Paired-end

リード長

150 bp

JGAデータセットAccession

JGAD001064

総データ量

64.8 GB (fastq)

利用ポリシー

NBDC policy