データセット ID
JGAD001064
- データの種類
- NGS(Exome)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 64.8 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0574
- 公開日
- 2026-07-27
- 更新日
- 2026-07-27
- DDBJ Search
- JGAD001064 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000920 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- BRCA1/2のgermline病的バリアントを有する胃腺がん(ICD10:C16.9):4症例 計8検体
Patient 1:肝転移巣(腫瘍)ならびに正常肝(非腫瘍)の新鮮凍結組織
Patient 2-4:原発巣(腫瘍)ならびに正常リンパ節(非腫瘍)の FFPE検体 - 健康状態罹患
- 対象者数4 (人数)
- 対象集団日本人
- 疾患
- BRCA1/2のgermline病的バリアントを有する胃腺がん
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V6
- 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp