2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC ヒトデータベース申請業務ならびにJGA関係の業務につきまして、以下の期間休業いたします：2026年8月12日(水) 〜 2026年8月17日(月) 休業期間中にいただいた申請やお問い合わせ等は、休業明けの 8月18日(火) より順次対応させていただきます。 上記休業期間の前後は通常より対応が遅れることがあります。予めご了承ください。 ご迷惑をおかけいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。
目的: 近年、全ゲノム重複は進行がんでもみられ、がんの転帰に関連するマクロ進化学的事象であることが示されている。しかしながら、全ゲノム重複による大規模なゲノム構造異常ががんゲノム進化にどう寄与するかは未だ不明な点が多い。大腸がんは、正常大腸粘膜上皮に複数のがん遺伝子・がん抑制遺伝子の異常が蓄積した結果、腺腫・粘膜内がん・浸潤がんへと進展していく多段階発がんが提唱され、発がんメカニズムが最もよく解明されている腫瘍の一つであるが、大腸がんにおいては全ゲノム重複などの大規模ゲノム構造異常が発がんに寄与するメカニズムの解明は進んでいない。本研究では、大腸がん組織を研究試料とし、多段階発がん過程における全ゲノム重複・染色体構造異常等の発生をmulti-region sequencing解析により推定し、がんの不均一性とがんクローンの進化との関連や腫瘍の進行・転移との関連を明らかにすることを目的とする。
研究方法: 全ゲノムシークエンス
対象: 大腸がん 62症例
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD001015 | 制限公開（Type I） | NGS(WGS) | 2026-06-11 | |
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構 (AMED) 革新的がん医療実用化研究事業 | 国際共同研究に資する大規模日本人がんゲノム・オミックス・臨床データ統合解析とゲノム予防・医療推進 |
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| 日本医療研究開発機構 (AMED) 革新的がん医療実用化研究事業 | 大腸癌ハイリスク患者の癌発症に関わる腸内環境変動の解明とそれに基づく大腸癌個別化予防法の開発に関する研究 |
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| 日本医療研究開発機構 (AMED) 革新的がん医療実用化研究事業 | 大腸癌超ハイリスク群における便ならびに生検組織を用いた腸内環境理解に基づく大腸癌個別化予防法の開発 |
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| 日本医療研究開発機構 (AMED) 革新的がん医療実用化研究事業 | オールジャパン体制による食道がん等消化器難治がんの全ゲノム配列データ及び臨床情報による先端的創薬開発・全ゲノム医療基盤構築 |
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| 日本医療研究開発機構 (AMED) 革新的がん医療実用化研究事業 | 日本人がんゲノム・オミックス統合解析による革新的な予防・診断・治療推進に資する大規模国際共同研究 |
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| 日本医療研究開発機構 (AMED) 次世代がん医療創生研究事業 (P-CREATE) | 腸内細菌解析による抗悪性腫瘍剤の有害作用発現予測に関する研究開発 |
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| 日本医療研究開発機構 (AMED) 次世代がん医療加速化研究事業 (P-PROMOTE) | 食事、腸内細菌、炎症の多面的解析に基づく若年発症大腸癌の本態解明と易罹患性・早期診断検査法の開発 |
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| 日本医療研究開発機構 (AMED) 地球規模保健課題解決推進のための研究事業 | 日米医学協力計画を基軸とした感染関連がんに関する疾患研究 |
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| 日本医療研究開発機構 革新的先端研究開発支援事業 (AMED-CREST) | 腸管局所マイクロバイオームの「個人差・性差」が大腸「未病状態」に及ぼす影響の解明と未病抑制戦略の開発 |
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| 日本医療研究開発機構 (AMED) 医療分野国際科学技術共同研究開発推進事業 (先端国際共同研究推進プログラム (ASPIRE)) | The ELDER Study: 臓器老化の高精度測定によるがん発症タイミングの解明 |
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| 科学研究費助成事業 基盤研究 (B) | 家族性大腸腺腫症を対象にしたメタゲノム解析とそれに基づく大腸癌発症進展機構の解明 |
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| 科学研究費助成事業 基盤研究 (B) | 大腸Serrated pathwayにおける腸内環境変動の解明 |
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タイトル | DOI | データセット |
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| Prevalence and chronology of colibactin-associated mutational processes and their microbiome spectra in Japanese colorectal cancer | https://doi.org/10.52843/cassyni.86lmq6 | |
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
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| データなし | |||||