データセット ID
JGAD001015
- データの種類
- NGS(WGS)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 14.2 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0543
- 公開日
- 2026-06-11
- 更新日
- 2026-06-11
- DDBJ Search
- JGAD001015 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000872 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- 大腸がん(ICD10:C189):62症例
腫瘍組織:62検体
非腫瘍組織(正常組織):62検体 - 健康状態罹患
- 対象者数62 (人数)
- 疾患
- 大腸がん
- 試料説明
- FFPE標本もしくは凍結標本の腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit
- 断片化
- 超音波断片化(Covaris)
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp