2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC ヒトデータベース申請業務ならびにJGA関係の業務につきまして、以下の期間休業いたします：2026年8月12日(水) 〜 2026年8月17日(月) 休業期間中にいただいた申請やお問い合わせ等は、休業明けの 8月18日(火) より順次対応させていただきます。 上記休業期間の前後は通常より対応が遅れることがあります。予めご了承ください。 ご迷惑をおかけいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。
目的: 二次リンパ組織における胚中心反応は高親和性抗体を産生するための反応であり、主に CD4+ T細胞によって制御されている。しかしヒトにおいて二次リンパ組織の CD4+ T 細胞の生態は十分に描写されていない。特に胚中心反応を抑制するIL10+ Foxp3− 濾胞CD4+ T (T follicular regulatory type 1, Tfr1) 細胞の分化・局在・多様性は未解明である。本研究はヒト二次リンパ組織におけるCD4+ T細胞を詳細に描写し、IL10+ Foxp3− 濾胞CD4+ T細胞の分化・局在・多様性を解明することを目的とする。
研究方法: 扁桃検体からFACSでCD4+T細胞 (whole または Tfr1-enriched) を分離し、1細胞マルチオミクス解析 (scRNA-seq、scRNA-TCR-seq、scATAC-RNA-seq) を行った。なお、一部の実験では CITE-seq を併用した。
対象: 慢性扁桃炎8症例の扁桃組織
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD000947 | 制限公開（Type I） | NGS(scRNA-seq、scRNA-TCR-seq、scATAC-RNA-seq) | 2025-07-07 | |
| E-GEAD-1086 | 非制限公開 | JGAS000805 / JGAD000947の加工データ NGS(scRNA-seq、scRNA-TCR-seq、scATAC-RNA-seq)のリードカウントデータ TCRレパトア情報 オープンクロマチン領域情報 | 2025-07-04 | |
研究プロジェクト名 | URL |
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| データなし | |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
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| データなし | ||
タイトル | DOI | データセット |
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| Single-cell multiomic analysis revealed the differentiation, localization, and heterogeneity of IL10+ Foxp3- follicular T cells in humans. | https://doi.org/10.1093/intimm/dxaf014 | |
名前 | 所属機関 | 国 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット一覧 |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田道昭 | Waseda University | Japan | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05—2027-10-31 | |