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NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間:2026年10月5日(月) 9:00 ~ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0491-v1リリース情報

最新

研究題目

アレルギー病態の分子機構解明

研究概要

目的
二次リンパ組織における胚中心反応は高親和性抗体を産生するための反応であり、主に CD4+ T細胞によって制御されている。しかしヒトにおいて二次リンパ組織の CD4+ T 細胞の生態は十分に描写されていない。特に胚中心反応を抑制するIL10+ Foxp3− 濾胞CD4+ T(T follicular regulatory type 1, Tfr1)細胞の分化・局在・多様性は未解明である。本研究はヒト二次リンパ組織におけるCD4+ T細胞を詳細に描写し、IL10+ Foxp3− 濾胞CD4+ T細胞の分化・局在・多様性を解明することを目的とする。
研究方法
扁桃検体からFACSでCD4+T細胞(whole または Tfr1-enriched)を分離し、1細胞マルチオミクス解析(scRNA-seq、scRNA-TCR-seq、scATAC-RNA-seq)を行った。なお、一部の実験では CITE-seq を併用した。
対象
慢性扁桃炎8症例の扁桃組織
URL
N/A

データセット

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
JGAD000947NGS(scRNA-seq、scRNA-TCR-seq、scATAC-RNA-seq)
  • scRNA-seq (± CITE-seq)
  • scRNA-seq + scTCR-seq (± CITE-seq)
  • scATAC-seq + scRNA-seq
制限公開(Type I)2025-07-07
E-GEAD-1086JGAS000805 / JGAD000947の加工データ
NGS(scRNA-seq、scRNA-TCR-seq、scATAC-RNA-seq)のリードカウントデータ
TCRレパトア情報
オープンクロマチン領域情報
  • scRNA-seq (± CITE-seq)
  • scRNA-seq + scTCR-seq (± CITE-seq)
  • scATAC-seq + scRNA-seq
非制限公開2025-07-03

提供者

研究代表者
上野 英樹
所属機関
京都大学医学系研究科 免疫細胞生物学

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

助成金情報はありません。

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
Single-cell multiomic analysis revealed the differentiation, localization, and heterogeneity of IL10+ Foxp3- follicular T cells in humans.

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関国・州名研究題目データ利用期間データセット ID
浜田 道昭浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学日本RNA標的創薬データベースの構築2023-01-05 – 2027-10-31