研究 ID
hum0491-v1リリース情報
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研究題目
アレルギー病態の分子機構解明
研究概要
- 目的
- 二次リンパ組織における胚中心反応は高親和性抗体を産生するための反応であり、主に CD4+ T細胞によって制御されている。しかしヒトにおいて二次リンパ組織の CD4+ T 細胞の生態は十分に描写されていない。特に胚中心反応を抑制するIL10+ Foxp3− 濾胞CD4+ T(T follicular regulatory type 1, Tfr1)細胞の分化・局在・多様性は未解明である。本研究はヒト二次リンパ組織におけるCD4+ T細胞を詳細に描写し、IL10+ Foxp3− 濾胞CD4+ T細胞の分化・局在・多様性を解明することを目的とする。
- 研究方法
- 扁桃検体からFACSでCD4+T細胞(whole または Tfr1-enriched)を分離し、1細胞マルチオミクス解析(scRNA-seq、scRNA-TCR-seq、scATAC-RNA-seq)を行った。なお、一部の実験では CITE-seq を併用した。
- 対象
- 慢性扁桃炎8症例の扁桃組織
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000947 | NGS(scRNA-seq、scRNA-TCR-seq、scATAC-RNA-seq) |
| 制限公開(Type I) | 2025-07-07 | |
| E-GEAD-1086 | JGAS000805 / JGAD000947の加工データ NGS(scRNA-seq、scRNA-TCR-seq、scATAC-RNA-seq)のリードカウントデータ TCRレパトア情報 オープンクロマチン領域情報 |
| 非制限公開 | 2025-07-03 |
提供者
- 研究代表者
- 上野 英樹
- 所属機関
- 京都大学医学系研究科 免疫細胞生物学
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
助成金情報はありません。
関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Single-cell multiomic analysis revealed the differentiation, localization, and heterogeneity of IL10+ Foxp3- follicular T cells in humans. |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田 道昭 | 浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05 – 2027-10-31 |