hum0468-v1リリース情報

免疫・炎症病態の解析

目的

自己免疫疾患や炎症性疾患の罹患組織における炎症病態は臓器構成細胞と免疫細胞の相互作用により生じる。一方で、罹患臓器局所に存在する細胞の詳細な性質は十分には理解されていない。近年の解析技術の進歩により、ヒト検体に含まれる細胞の詳細な解析が可能になってきた。これらの解析により、例えば免疫細胞において末梢血液に存在するものと組織に存在するもので遺伝子の発現が異なり、罹患組織の細胞を解析する重要性が明らかになっている。本研究では自己免疫疾患や炎症性疾患の罹患組織における構成細胞や免疫細胞を詳細に解析することで、ヒトでの自己免疫・炎症病態を解明することを目的とする。さらに、DNA解析の同意を得られている対象者の遺伝子背景と組織や末梢血における遺伝子発現の関連を解析することで、GWASなどで疾患に関連が指摘されているものの機能が不明であった遺伝子変異の病態における役割を解明する。

研究方法

single cell RNA-seq、bulk RNA-seq、scASAP-seq CITE-seq、VDJ-seq、空間トランスクリプトーム（Xenium）

対象

【scRNA-seq】 関節リウマチ11＋10症例由来の血液検体（10＋9検体）、関節液検体（4＋4検体）、滑膜検体（11＋10検体）、および、対照健常者3名由来の血液検体（3検体）、関節リウマチ1症例の関節液T細胞と対照健常者1名の血液単球を共培養した検体（1検体）
【bulk RNA-seq】 関節リウマチ1症例由来の関節液検体（1検体）、対照健常者1名由来の血液検体（1検体）
【scASAP-seq】 関節リウマチ1症例由来の滑膜検体（1検体）
【CITE-seq】 関節リウマチ10症例由来の血液検体（9検体）、関節液検体（4検体）、滑膜検体（10検体）、関節リウマチ1症例の関節液T細胞と対照健常者1名の血液単球を共培養した検体（1検体）
【VDJ-seq】 関節リウマチ10症例由来の血液検体（9検体）、関節液検体（4検体）、滑膜検体（10検体）
【Xenium】 関節リウマチ3症例由来の滑膜検体（3検体）

URL

N/A

研究代表者

吉富 啓之

所属機関

京都大学大学院医学研究科 免疫細胞生物学

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報はありません。