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NBDC ヒトデータベース

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2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0404-v1リリース情報

最新

研究題目

循環器疾患のゲノム解析技術、iPS細胞技術、ゲノム編集技術を用いた病態解明ならびに治療法開発研究 / 循環器疾患患者由来iPS細胞を用いた病態解明ならびに新規医療技術開発研究

研究概要

目的
重症心不全をはじめとする種々の循環器疾についてゲノム解析を実施し、病態に関係すると考えられる遺伝子多型を同定することにより、循環器疾患の病態解明・新規治療介入の開発をおこなう。iPS細胞を用いた解析においては、遺伝子多型と表現型の対応を検討するため、CRISPR/Cas9システムなどのゲノム編集技術を用いた変異修復を行うことで、表現型への影響を確認する。
研究方法
【scRNA-seq】心筋症症例の末梢血から樹立したiPS細胞由来分化心筋細胞に、GFP(コントロール)またはS-RBD-sfGFPを添加後48時間で細胞を回収し、シングルセルRNAシークエンス解析を実施した
【WGS】心筋症症例の末梢血から抽出したDNAを用いた全ゲノムシークエンス
対象
心筋症1症例から樹立したiPS細胞由来分化心筋細胞、および、心筋症3症例の末梢血

データセット

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
JGAD000749NGS(scRNA-seq)
  • scRNA-seq
制限公開(Type I)2025-10-01
E-GEAD-628NGS(scRNA-seq)
  • scRNA-seq
非制限公開2023-12-06
JGAD000837NGS(WGS)
  • WGS
制限公開(Type I)2025-10-01
JGAD000838NGS(WGS)
  • WGS
制限公開(Type I)2025-10-01
JGAD000839NGS(WGS)
  • WGS
制限公開(Type I)2025-10-01

提供者

研究代表者
肥後 修一朗
所属機関
大阪大学 大学院医学系研究科 循環器内科学 重症心不全内科治療学共同研究講座

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

助成金情報はありません。

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain is internalized and promotes protein ISGylation in human induced pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes

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