2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
目的: 重症心不全をはじめとする種々の循環器疾についてゲノム解析を実施し、病態に関係すると考えられる遺伝子多型を同定することにより、循環器疾患の病態解明・新規治療介入の開発をおこなう。iPS細胞を用いた解析においては、遺伝子多型と表現型の対応を検討するため、CRISPR/Cas9システムなどのゲノム編集技術を用いた変異修復を行うことで、表現型への影響を確認する。
研究方法: 【scRNA-seq】心筋症症例の末梢血から樹立したiPS細胞由来分化心筋細胞に、GFP (コントロール) またはS-RBD-sfGFPを添加後48時間で細胞を回収し、シングルセルRNAシークエンス解析を実施した 【WGS】心筋症症例の末梢血から抽出したDNAを用いた全ゲノムシークエンス
対象: 心筋症1症例から樹立したiPS細胞由来分化心筋細胞、および、心筋症3症例の末梢血
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD000749 | 制限公開（Type I） | NGS(scRNA-seq) | 2025-10-01 | |
| E-GEAD-628 | 非制限公開 | NGS(scRNA-seq) | 2025-09-30 | |
| JGAD000837 | 制限公開（Type I） | NGS(WGS) | 2025-10-01 | |
| JGAD000838 | 制限公開（Type I） | NGS(WGS) | 2025-10-01 | |
| JGAD000839 | 制限公開（Type I） | NGS(WGS) | 2025-10-01 | |
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
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| データなし | ||
タイトル | DOI | 利用データID |
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| SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain is internalized and promotes protein ISGylation in human induced pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes | https://doi.org/10.1038/s41598-023-48084-7 | |
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
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| データなし | |||||