2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
目的: 新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) の病態生理及びコロナワクチン接種後の免疫動態を解析し、臨床分野での応用を目指す。
研究方法: single cell RNA-seq: COVID-19患者16症例 (ARDS合併；8症例、ARDS非合併；8症例) と対照健常者5名の末梢血単核球をシングルセルRNA sequenceで解析。 RNA-seq: 健常者4名の末梢血単核球由来の単球から抽出したtotal RNAをRNA sequenceで解析。 ATAC-seq: 健常者5名の末梢血単核球由来の単球から抽出したDNAをATAC sequenceで解析。
対象: single cell RNA-seq: COVID-19患者: 16症例 (ARDS合併；8例、ADRS非合併；8例) 、対照健常者: 5名 RNA-seq: 健常者4名 (各4検体、いずれも末梢血) ATAC-seq: 健常者5名 (各4ないしは5検体、いずれも末梢血)
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| E-GEAD-551 | 非制限公開 | NGS(scRNA-seq) | 2023-03-16 | |
| E-GEAD-552 | 非制限公開 | NGS(RNA-seq) NGS(ATAC-seq) | 2023-03-16 | |
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
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| 科学研究費助成事業 基盤研究 (S) | 神経・免疫・代謝におけるガイダンス因子の病的意義の解明とその制御 |
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タイトル | DOI | 利用データID |
|---|---|---|
| Consecutive BNT162b2 mRNA vaccination induces short-term epigenetic memory in innate immune cells | https://doi.org/10.1172/jci.insight.163347 | |
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
|---|---|---|---|---|---|
| データなし | |||||