研究題目
子宮頸部腺癌・扁平上皮癌、腟・外陰癌の発生及び予後決定に関わる遺伝子異常の検索
研究概要
目的: 現在、子宮頸部腺がんのような治療抵抗性の悪性腫瘍の発生及び予後決定に関わる明確な因子は同定されていない。本研究において、子宮頸部腺がんの分子生物学的特徴を、その他の子宮頸がん (扁平上皮がん) や腟・ 外陰部がんの発がんの分子生物学的特徴と対比した上で、子宮頸部腺がんの発生や予後決定に関わる分子マーカーを同定する。子宮頸部扁平上皮がんの中には若年発症かつ予後不良のがんも存在し、子宮頸部小細胞がんも進行が速く予後不良であることから、診断法・治療法の確立は急務である。
研究方法: 全エクソン解析、RNAシークエンス解析、シングルセルRNAシークエンス解析、ターゲットバイサルファイトシークエンス解析
対象: 子宮頸がん19+4+96症例、NIKS18細胞株 ・全エクソンシークエンス: 1症例由来の腫瘍組織・腫瘍組織由来オルガノイド・末梢血各1検体、4症例由来の腫瘍組織 (8検体) ・末梢血 (2検体) ・腫瘍近傍の正常組織 (2検体) 、96症例由来の腫瘍組織 (96検体) ・RNA-seq: 1症例由来の腫瘍組織・腫瘍由来オルガノイドの2検体、13症例由来の腫瘍組織 (13検体) 、5症例由来の同一腫瘍内複数検体 (77検体) 、3症例由来の正常子宮頸部由来オルガノイド (3検体) 、1症例由来の正常子宮頸部マイクロダイセクションで取得した4検体、NIKS18細胞株に対してsiRNA knockdownを行ったサンプル5検体 ・single-cell RNA-seq: 1症例由来の正常子宮頸部由来オルガノイド ・ターゲットバイサルファイトシークエンス: 96症例由来の腫瘍組織 (96検体)
