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研究題目

バイオバンク・ジャパンの運営・管理と個別化医療の実現に向けた疾患バイオマーカー探索 疾患コホート研究ネットワークによる疾患マーカー探索研究

研究概要

目的: バイオバンク・ジャパン (BBJ) は、東京大学医科学研究所内に設置された臨床情報と生体試料 (DNA・血清) のバイオバンクで、平成15 (2003) 年に委託事業として出発した「オーダーメイド医療実現化プロジェクト」により国内12協力医療機関と協力して収集された47疾患・約20万人 (第一コホート) 、並びに平成25 (2013) 年度に開始した「オーダーメイド医療の実現プログラム」により同様の方法で収集された38疾患・約6.7万人 (第二コホート) からなる我が国の重要な研究基盤である。 本研究ではBBJが管理する試料・臨床情報及びゲノム情報のさらなる利活用を目指して、試料・情報の保管、管理、提供を継続して実施するとともに、生体試料やゲノム情報、臨床情報を用いて疾患のリスクや予後、薬剤感受性に関わるバイオマーカーを同定し、個別化医療に貢献する。

研究方法: Asian Screening Array (ASA-24v1-0_A2) による塩基配列決定 TOPMed r2を用いたimputationデータ (GRCh38) 血清サンプルについてNMR装置により取得したスペクトラムの250代謝物の定量データ 血清サンプルについてのプロテオミクス解析データ 消化性潰瘍のゲノムワイド関連解析

対象: BBJ第一コホート (11,716+180,882+1,285+2,570+40,907+3,050名) 、BBJ第二コホート (42,689名) 、ToMMo (49,621名) 、UKバイオバンク (456,327名) 、FinnGen (230,635名)

データセット一覧

データセット ID
アクセス制限
データの種類
公開日
JGAD000529制限公開(Type I)BBJ第一コホート11,716名、BBJ第二コホート42,689名のGenotypeデータ2021-12-13
JGAD000660制限公開(Type I)BBJ第一コホート180,882名を男女別に7つのバッチに分けて実施したImputationデータならびにindexデータ2022-08-12
JGAD000683制限公開(Type I)BBJ第一コホート1,285名の血清サンプルを対象としたNMRによるメタボロームデータ2022-09-27
hum0311.v5.gwas.v1非制限公開消化性潰瘍のGWAS2023-07-27

提供者情報

    研究代表者
    松田 浩一
    所属機関名
    東京大学大学院 新領域創成科学研究科

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名
URL
利活用を目的とした日本疾患バイオバンクの運営・管理https://biobankjp.org/

助成金情報

科研費・助成金名
タイトル
研究課題番号
日本医療研究開発機構 (AMED) ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム (B-Cure)利活用を目的とした日本疾患バイオバンクの運営・管理
  • JP20km0605001
  • JP23tm0624002
日本医療研究開発機構 (AMED) ゲノム医療実現推進プラットフォーム事業TOPMED panelを用いた高密度Imputationによる、バイオバンクジャパン18万症例のphenotype横断的解析
  • JP21km0405215

関連論文

タイトル
DOI
利用データID
East Asian-specific and cross-ancestry genome-wide meta-analyses provide mechanistic insights into peptic ulcer diseasehttps://doi.org/10.1038/s41588-023-01569-7
Genotype imputation accuracy and the quality metrics of the minor ancestry in multi-ancestry reference panelshttps://doi.org/10.1093/bib/bbad509

制限公開データの利用者一覧

研究代表者
所属機関
国・州名
研究題目
データ利用期間
利用データID
大野敦司Hiroshima UniversityJapan肝疾患の課題解決にむけたゲノム情報の活用2025-06-252034-03-31
野口恵美子University of TsukubaJapan炎症性肺疾患の遺伝素因に関する研究2024-05-092028-03-31
上辻󠄀茂男StaGen Co., Ltd.Japan斜視の遺伝的要因の検証のためのゲノムワイド関連研究2023-02-142027-02-28
福永航也RIKEN Center for Integrative Medical SciencesJapan重篤な皮膚有害事象の診断・治療と遺伝子マーカーに関する研究2023-02-102026-03-02
白石航也National Cancer Center Research InstituteJapanゲノム解析に基づく宿主並びに腫瘍における免疫応答ネットワーク機構の解明2024-06-242025-12-15
徳永勝士Japan Institute for Health Security, National Institute of Global Health and MedicineJapan日本人大規模全ゲノム情報を基盤とした多因子疾患関連遺伝子の同定を加速する情報解析技術の開発と応用2026-07-102027-03-31
長﨑正朗Kyushu UniversityJapan日本人大規模全ゲノム情報を基盤とした多因子疾患関連遺伝子の同定を加速する情報解析技術の開発と応用(ゲノム情報解析技術開発)2024-06-242027-03-31
莚田泰誠RIKEN Center for Integrative Medical SciencesJapan薬疹関連遺伝子の探索2021-03-262028-03-31
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加藤規弘National Center for Global Health and MedicineJapan原発性アルドステロン症の遺伝素因とその臨床的意義に関する研究2024-06-242029-03-31
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加藤正樹missingJapan精神疾患個別化治療アルゴリズムの構築を目的とする生物学的反応因子の探索・検証試験2023-08-252028-06-30
木村亮介University of the RyukyusJapanヒト全ゲノム配列基盤情報の整備および集団遺伝学・分子進化学解析2025-09-172028-03-31
堀江重郎Juntendo University, Graduate School of MedicineJapan血液細胞のY染色体モザイクロスに伴う疾患リスク解析2025-11-132030-03-31
寺尾知可史Fujita Health UniversityJapan統合ゲノミクス情報を基盤とした個別化医療の研究2023-11-212036-03-31
寺尾知可史Shizuoka General HospitalJapanヒト形質関連遺伝因子に関する研究2024-04-252028-12-03
岡本師Tokyo Medical and Dental UniversityJapan間質性肺炎の原因あるいは関連遺伝子解析に関する前向き研究2024-04-122027-03-31
朝野仁裕National Cerebral and Cardiovascular Center,Japan循環器疾患におけるゲノム医療推進のための全国規模プラットフォームの構築2023-12-142035-03-31
朝野仁裕Osaka UniversityJapan遺伝性心血管疾患の感受性遺伝子解析研究2021-07-262027-05-31
高地雄太Tokyo Medical and Dental UniversityJapan機能性遺伝子多型の網羅的解析を介した多因子疾患の病態解明2023-04-122028-03-31
岡田随象Osaka UniversityJapan多層的オミクス解析による疾患病態の解明2022-09-152029-03-31