データセット ID
JGAD000529
- データの種類
- BBJ第一コホート11,716名、BBJ第二コホート42,689名のGenotypeデータ
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 1.1 TB
- ファイル形式
- BED
- BIM
- FAM
- IDAT
- CSV
- 研究
- hum0311
- 公開日
- 2021-12-13
- 更新日
- 2021-12-13
- DDBJ Search
- JGAD000529 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000412 (新しいタブで開きます)
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- BBJ第一コホート(47疾患):11,716名
BBJ第二コホート(38疾患):42,689名
ICD10:C34, C15, C16, C18-C21, C22, C25, C23, C24, C61, C50, C53, C54, C56, C81-C86, C90-C93, I63, G45.9, I67.1, G40, J45, A15-A19, J44.9, J84.1-9, I21.0-9, I20.0, I20.1, I20.8, I20.9, R00, I44.0-3, I45.5-6, I47-I49, I50, I70.9, B18.1, B18.2, K74.6, N04, N20-N23, M80-M81, E10, E11, E88.8, E78.0-5, E78.8-9, E05.0, M05-M06, J30.1, L91.0, L20, L51.1-2, L27.0, D25, N80, R56.0, H40, H25-H26, K05, G12.2, I61, C64 - 健康状態罹患
- 対象者数54,405 (人数)
- コホートBioBank Japan
- 対象集団日本人
- 試料説明
- 末梢血(一部唾液)から抽出したDNA
- 組織末梢血、唾液
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Infinium Asian Screening Array Kit
- プラットフォーム
- Illumina Infinium Asian Screening Array
- 参照ゲノム
- GRCh38
- 解析方法
- GenomeStudio
- バリアント数
- 657,060 SNVs