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NBDC ヒトデータベース

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2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD000529

データの種類
BBJ第一コホート11,716名、BBJ第二コホート42,689名のGenotypeデータ
アクセス制限
制限公開(Type I)
総データ量
1.1 TB
ファイル形式
  • BED
  • BIM
  • FAM
  • IDAT
  • CSV
研究
hum0311
公開日
2021-12-13
更新日
2021-12-13

解析手法

Genotyping by array

材料と対象者
BBJ第一コホート(47疾患):11,716名
BBJ第二コホート(38疾患):42,689名
ICD10:C34, C15, C16, C18-C21, C22, C25, C23, C24, C61, C50, C53, C54, C56, C81-C86, C90-C93, I63, G45.9, I67.1, G40, J45, A15-A19, J44.9, J84.1-9, I21.0-9, I20.0, I20.1, I20.8, I20.9, R00, I44.0-3, I45.5-6, I47-I49, I50, I70.9, B18.1, B18.2, K74.6, N04, N20-N23, M80-M81, E10, E11, E88.8, E78.0-5, E78.8-9, E05.0, M05-M06, J30.1, L91.0, L20, L51.1-2, L27.0, D25, N80, R56.0, H40, H25-H26, K05, G12.2, I61, C64
  • 健康状態
    罹患
  • 対象者数
    54,405 (人数)
  • コホート
    BioBank Japan
  • 対象集団
    日本人
試料説明
末梢血(一部唾液)から抽出したDNA
  • 組織
    末梢血、唾液
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    非腫瘍
試料の入手元
N/A
実験方法
Genotyping by array
測定対象
N/A
試薬キット
Infinium Asian Screening Array Kit
プラットフォーム
Illumina Infinium Asian Screening Array
参照ゲノム
GRCh38
解析方法
GenomeStudio
バリアント数
657,060 SNVs