データセット ID
JGAD000927
- データの種類
- BBJ第一コホート3,050名の血清サンプルを対象としたプロテオミクス解析データ
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 478 MB
- ファイル形式
- ADAT
- NPX
- CSV
- PPTX
- TAR
- 研究
- hum0311
- 公開日
- 2025-06-13
- 更新日
- 2025-06-13
- DDBJ Search
- JGAD000927 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000785 (新しいタブで開きます)
解析手法
Proteomics (Olink 2926/1196 + SomaScan 7596 proteins)
- 材料と対象者
- BBJ第一コホート 3,050名 （ICD10：C169、C189、C20、C509、C61、I219、L270）
（1） 2,962名（東京大学にて解析）
（2） 上記2,962名に含まれる256名（東京大学にて解析）
（3） 上記2,962名かつ256名に含まれる82名（FonesLife社にて解析）
（4） 上記とは別の88名（タカラバイオ社にて解析） - 健康状態罹患
- 対象者数3050 (人数)
- コホートBioBank Japan
- 疾患
- BBJ第一コホート
- 試料説明
- 血清サンプル
- 組織血清
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Proteomics
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Olink Explore 3072
Olink Target 96
SomaScan - プラットフォーム
- Olink Explore 3072
Olink Target 96
SomaLogic SomaScan - 正規化
- （1） 各バッチ内でIntensity normalization、および3つのバッチにわたる24サンプルを用いたbridge normalization
（2） Intensity normalization
（3） Adaptive Normalization by Maximum Likelihood（ANML）
（4） Plate normalization - 解析方法
- （1） Olink NPX Explore v1.7.1
（2） Olink NPX Signature 1.7.0.0
（3） 検出は製造元によって実施
（4） Olink NPX Explore v1.7.1