研究 ID
hum0311-v2リリース情報
このページは過去のバージョン (v2) です。最新のバージョンは v7 です。
最新バージョン (v7)研究題目
バイオバンク・ジャパンの運営・管理と個別化医療の実現に向けた疾患バイオマーカー探索 / 疾患コホート研究ネットワークによる疾患マーカー探索研究
研究概要
- 目的
- バイオバンク・ジャパン（BBJ）は、東京大学医科学研究所内に設置された臨床情報と生体試料（DNA・血清）のバイオバンクで、平成15（2003）年に委託事業として出発した「オーダーメイド医療実現化プロジェクト」により国内12協力医療機関と協力して収集された47疾患・約20万人（第一コホート）、並びに平成25（2013）年度に開始した「オーダーメイド医療の実現プログラム」により同様の方法で収集された38疾患・約6.7万人（第二コホート）からなる我が国の重要な研究基盤である。 本研究ではBBJが管理する試料・臨床情報及びゲノム情報のさらなる利活用を目指して、試料・情報の保管、管理、提供を継続して実施するとともに、生体試料やゲノム情報、臨床情報を用いて疾患のリスクや予後、薬剤感受性に関わるバイオマーカーを同定し、個別化医療に貢献する。
- 研究方法
- Asian Screening Array （ASA-24v1-0_A2）による塩基配列決定
TOPMed r2を用いたimputationデータ（GRCh38）
血清サンプルについてNMR装置により取得したスペクトラムの250代謝物の定量データ
血清サンプルについてのプロテオミクス解析データ
消化性潰瘍のゲノムワイド関連解析 - 対象
- BBJ第一コホート（11,716＋180,882＋1,285＋2,570＋40,907＋3,050名）、BBJ第二コホート（42,689名）、ToMMo（49,621名）、UKバイオバンク（456,327名）、FinnGen（230,635名）
データセット
データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000529 | BBJ第一コホート11,716名、BBJ第二コホート42,689名のGenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2021-12-13 | |
| JGAD000660 | BBJ第一コホート180,882名を男女別に7つのバッチに分けて実施したImputationデータならびにindexデータ |
| 制限公開（Type I） | 2022-08-12 |
提供者
- 研究代表者
- 松田 浩一
- 所属機関
- 東京大学大学院 新領域創成科学研究科
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
利活用を目的とした日本疾患バイオバンクの運営・管理 |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
日本医療研究開発機構（AMED） ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム（B-Cure） | 利活用を目的とした日本疾患バイオバンクの運営・管理 |
|
日本医療研究開発機構（AMED） ゲノム医療実現推進プラットフォーム事業 | TOPMED panelを用いた高密度Imputationによる、バイオバンクジャパン18万症例のphenotype横断的解析 |
|
関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
East Asian-specific and cross-ancestry genome-wide meta-analyses provide mechanistic insights into peptic ulcer disease | ||
Genotype imputation accuracy and the quality metrics of the minor ancestry in multi-ancestry reference panels |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 莚田 泰誠 | ファーマコゲノミクス研究チーム, 理化学研究所 生命医科学研究センター | 日本 | 小麦アレルギーの遺伝子多型解析 | 2021-03-26 – 2028-03-31 | |
| 朝野 仁裕 | 大学院医学系研究科循環器内科学, 大阪大学 | 日本 | 遺伝性心血管疾患の感受性遺伝子解析研究 | 2021-07-26 – 2027-05-31 | |
| 小川 誠司 | 腫瘍生物学講座, 京都大学医学部医学研究科 | 日本 | クローン性造血と新型コロナウイルス感染症の関連性についての解析 | 2022-08-18 – 2026-08-05 | |
| 岡田 随象 | 大学院医学系研究科遺伝統計学, 大阪大学 | 日本 | 日本人由来B細胞株DNAのゲノムデータを用いた遺伝統計解析手法の研究 | 2022-09-15 – 2029-03-31 | |
| 福永 航也 | 医薬安全科学部, 国立医薬品食品衛生研究所 | 日本 | 重篤な皮膚有害事象の診断・治療と遺伝子マーカーに関する研究 | 2023-02-10 – 2026-03-02 | |
| 福永 航也 | 医薬安全科学部, 国立医薬品食品衛生研究所 | 日本 | 薬剤性間質性肺疾患の発症に関連するバイオマーカーの探索研究 | 2023-02-10 – 2026-03-02 | |
| 福永 航也 | 医薬安全科学部, 国立医薬品食品衛生研究所 | 日本 | 薬物性肝障害の発症に関連するバイオマーカーの探索研究 | 2023-02-10 – 2024-04-02 | |
| 福永 航也 | 医薬安全科学部, 国立医薬品食品衛生研究所 | 日本 | 横紋筋融解症の発症に関連するバイオマーカーの探索研究 | 2023-02-10 – 2026-03-02 | |
| 上辻󠄀 茂男 | 統計解析事業部, 株式会社スタージェン | 日本 | 斜視の遺伝的要因の検証のためのゲノムワイド関連研究 | 2023-02-14 – 2027-02-28 | |
| 高地 雄太 | 難治疾患研究所ゲノム機能多様性分野, 東京医科歯科大学 | 日本 | 機能性遺伝子多型の網羅的解析を介した多因子疾患の病態解明 | 2023-04-12 – 2028-03-31 | |
| 加藤 正樹 | 精神神経科, 関西医科大学 | 日本 | 精神疾患個別化治療アルゴリズムの構築を目的とする生物学的反応因子の探索・検証試験 | 2023-08-25 – 2028-06-30 | |
| 木村 大樹 | 精神医学分野, 名古屋大学大学院医学系研究科 | 日本 | 遺伝子解析による脳とこころの病気に対するかかりやすさ（発症脆弱性）や薬の効きめや副作用（治療反応性）等の解明に関する研究 | 2023-11-17 – 2028-10-28 | |
| 朝野 仁裕 | ゲノム医療支援部, 国立循環器病研究センター | 日本 | 循環器疾患におけるゲノム医療推進のための全国規模プラットフォームの構築 | 2023-12-14 – 2035-03-31 | |
| 寺尾 知可史 | ゲノム解析応用研究チーム, 理化学研究所生命医学研究センター | 日本 | ゲノミクス情報を基盤とした個別化医療の研究 | 2023-11-21 – 2026-07-10 | |
| 岡本 師 | 長寿・健康人生推進センター, 東京医科歯科大学 | 日本 | 間質性肺炎の原因あるいは関連遺伝子解析に関する前向き研究 | 2024-04-12 – 2027-03-31 | |
| 寺尾 知可史 | 臨床研究部 免疫研究部, 静岡県立総合病院 | 日本 | ヒト形質関連遺伝因子に関する研究 | 2024-04-25 – 2028-12-03 | |
| 長﨑 正朗 | 生体防御医学研究所附属高深度オミクスサイエンスセンターバイオメディカル情報解析分野, 九州大学 | 日本 | 日本人大規模全ゲノム情報を基盤とした多因子疾患関連遺伝子の同定を加速する情報解析技術の開発と応用（ゲノム情報解析技術開発） | 2024-06-24 – 2027-03-31 | |
| 野口 恵美子 | 医学医療系遺伝医学, 筑波大学 | 日本 | 小麦依存性運動誘発アナフィラキシーの原因遺伝子解析とそれに対応する小麦品種の探索 | 2024-05-09 – 2028-03-31 | |
| 加藤 規弘 | 遺伝子診断治療開発研究部, 国立国際医療研究センター | 日本 | 原発性アルドステロン症の遺伝素因とその臨床的意義に関する研究 | 2024-06-24 – 2029-03-31 | |
| 白石 航也 | 臨床ゲノム解析部門, 国立がん研究センター研究所 | 日本 | 肺がんの個別化予防に資する遺伝要因の同定を目指す研究 | 2024-06-24 – 2025-12-15 | |
| 莚田 泰誠 | ファーマコゲノミクス研究チーム, 理化学研究所 生命医科学研究センター | 日本 | 薬疹関連遺伝子の探索 | 2024-08-01 – 2028-03-31 | |
| 大野 敦司 | 大学院 医系科学研究科 消化器内科学, 広島大学 | 日本 | 肝疾患の課題解決にむけたゲノム情報の活用 | 2025-06-25 – 2034-03-31 | |
| 木村 亮介 | 大学院医学研究科人体解剖学講座, 琉球大学 | 日本 | ヒト全ゲノム配列基盤情報の整備および集団遺伝学・分子進化学解析 | 2025-09-17 – 2028-03-31 | |
| 徳永 勝士 | ゲノム医科学プロジェクト, 国立健康危機管理研究機構 国立国際医療研究所 | 日本 | 日本人大規模全ゲノム情報を基盤とした多因子疾患関連遺伝子の同定を加速する情報解析技術の開発と応用 | 2026-07-10 – 2027-03-31 | |
| 堀江 重郎 | 泌尿器外科学, 順天堂大学大学院医学研究科 | 日本 | プロテオミクスデータとメタボロミクスデータを用いた生物学的年齢モデルの検証 | 2025-11-13 – 2030-03-31 | |
| 寺尾 知可史 | 研究推進本部 ゲノミクス医学センター, 藤田医科大学 | 日本 | 統合ゲノミクス情報を基盤とした個別化医療の研究 | 2026-09-03 – 2036-03-31 |