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NBDC Research ID:hum0302-v2
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研究題目

iPS細胞の高次特性解析と加工iPS細胞の作製

研究概要

目的: iPS細胞株 (健常人及び疾患特異的iPS細胞株) を使用し、分化能解析 (疾患原因細胞や関与細胞への分化能の評価) 、疾患原因遺伝子の解析、全ゲノム解析等の高次特性解析を実施する。また、ゲノム編集技術等を利用して (1) 疾患原因遺伝子を正常遺伝子に置換した疾患特異的iPS細胞株 (isogenic control cell) 、疾患特異的iPS細胞における疾患原因遺伝子を正常遺伝子に置換した細胞 (isogenic control cell) 、 (2) 正常遺伝子を疾患原因遺伝子に置換した細胞株 (人工作製疾患特異的iPS細胞株) 、 (3) 組織特異的及び/又は分化段階特異的にマーカー (蛍光マーカー等) を発現する加工iPS細胞株を作製する。

研究方法: 【JGAS000382】ヒトiPS細胞から肝細胞を分化誘導し、19日目に回収。RNAを抽出後PolyA選択法により作製したストランド特異的ライブラリーのシークエンシング解析をNovaseq6000にて行った (サンプルあたり約6Gb [約2000万ペアリード相当]のデータ出力) 。 【JGAS000683】ヒトiPS細胞から腎臓オルガノイドを分化誘導し、18日目に回収。RNAを抽出後PolyA選択法により作製したストランド特異的ライブラリーのシークエンシング解析をNovaseq6000にて行った (サンプルあたり約6Gb [約2000万ペアリード相当]のデータ出力) 。

対象: ウイルソン病 (指定難病171) 患者由来iPS細胞株、若年性ネフロン癆 (NPH1) 患者由来iPS細胞株ならびに、健常人由来iPS細胞株

データセット一覧

データセット ID
アクセス制限
データの種類
公開日
JGAD000497制限公開(Type I)NGS(RNA-seq)2021-11-10
JGAD000816制限公開(Type I)NGS(RNA-seq)2024-03-15

提供者情報

    研究代表者
    林 洋平
    所属機関
    理化学研究所 バイオリソース研究センター

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名
URL
iPS細胞高次特性解析開発チームhttps://acd.brc.riken.jp/ja/

助成金情報

科研費・助成金名
タイトル
研究課題番号
データなし

関連論文

タイトル
DOI
データセット
Retinoids rescue ceruloplasmin secretion and alleviate oxidative stress in Wilson's disease-specific hepatocytes.https://doi.org/10.1093/hmg/ddac080

制限公開データの利用者一覧

研究代表者
所属機関
国・州名
研究題目
データ利用期間
利用データID
データなし