データセット ID
JGAD000497
- データの種類
- NGS(RNA-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 45.6 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0302
- 公開日
- 2021-11-10
- 更新日
- 2021-11-10
- DDBJ Search
- JGAD000497 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000382 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- ウィルソン病(ICD10:E830)患者由来iPS細胞から分化誘導させた肝細胞サンプル:5検体
ウイルソン病患者由来iPS細胞をゲノム編集し、ATP7B変異を修復した肝細胞サンプル:1検体
健常人由来iPS細胞から分化誘導させた肝細胞サンプル:5検体
健常人由来iPS細胞をゲノム編集し、ATP7B変異を導入した肝細胞サンプル:1検体
計12検体 - 健康状態混在
- 対象者数30 (検体数)
- 疾患
- ウィルソン病 (E830)
- 試料説明
- iPS細胞から分化誘導させた肝細胞および腎臓オルガノイドから抽出したRNA
- 組織Hepatocyte、Kidney organoid
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 断片化
- GeneWiz社のプロトコルに準拠
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp