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NBDC ヒトデータベース

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システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間：2026年10月5日(月) 9:00 ～ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0302-v2リリース情報

最新

研究題目

iPS細胞の高次特性解析と加工iPS細胞の作製

研究概要

目的
iPS細胞株（健常人及び疾患特異的iPS細胞株）を使用し、分化能解析（疾患原因細胞や関与細胞への分化能の評価）、疾患原因遺伝子の解析、全ゲノム解析等の高次特性解析を実施する。また、ゲノム編集技術等を利用して（1）疾患原因遺伝子を正常遺伝子に置換した疾患特異的iPS細胞株（isogenic control cell）、疾患特異的iPS細胞における疾患原因遺伝子を正常遺伝子に置換した細胞（isogenic control cell）、（2）正常遺伝子を疾患原因遺伝子に置換した細胞株（人工作製疾患特異的iPS細胞株）、（3）組織特異的及び/又は分化段階特異的にマーカー（蛍光マーカー等）を発現する加工iPS細胞株を作製する。
研究方法
【JGAS000382】ヒトiPS細胞から肝細胞を分化誘導し、19日目に回収。RNAを抽出後PolyA選択法により作製したストランド特異的ライブラリーのシークエンシング解析をNovaseq6000にて行った（サンプルあたり約6Gb [約2000万ペアリード相当]のデータ出力）。
【JGAS000683】ヒトiPS細胞から腎臓オルガノイドを分化誘導し、18日目に回収。RNAを抽出後PolyA選択法により作製したストランド特異的ライブラリーのシークエンシング解析をNovaseq6000にて行った（サンプルあたり約6Gb [約2000万ペアリード相当]のデータ出力）。
対象
ウイルソン病（指定難病171）患者由来iPS細胞株、若年性ネフロン癆（NPH1）患者由来iPS細胞株ならびに、健常人由来iPS細胞株
URL

データセット

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
JGAD000497NGS（RNA-seq）
  • RNA-seq
制限公開（Type I）2021-11-10
JGAD000816NGS（RNA-seq）
  • RNA-seq
制限公開（Type I）2024-03-15

提供者

研究代表者
林 洋平
所属機関
理化学研究所 バイオリソース研究センター

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名URL
iPS細胞高次特性解析開発チーム

助成金情報

助成金情報はありません。

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
Retinoids rescue ceruloplasmin secretion and alleviate oxidative stress in Wilson's disease-specific hepatocytes.
https://doi.org/10.1093/hmg/ddac080 (新しいタブで開きます)

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