データセット ID
JGAD000816
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 72.9 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0302
- 公開日
- 2024-03-15
- 更新日
- 2024-03-15
- DDBJ Search
- JGAD000816 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000683 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 若年性ネフロン癆（NPH1）（ICD10：N19）患者由来iPS細胞から分化誘導させた腎臓オルガノイドサンプル：6検体
若年性ネフロン癆（NPH1）患者由来iPS細胞に責任遺伝子NPHP1を過剰発現させてから分化誘導させた腎臓オルガノイドサンプル：6検体
健常人由来iPS細胞から分化誘導させた腎臓オルガノイドサンプル：3検体
健常人由来iPS細胞をゲノム編集し、NPHP1変異を導入した腎臓オルガノイドサンプル：3検体
計18検体 - 健康状態混在
- 対象者数30 (検体数)
- 疾患
- 若年性ネフロン癆（NPH1） (N19)
- 試料説明
- iPS細胞から分化誘導させた肝細胞および腎臓オルガノイドから抽出したRNA
- 組織Hepatocyte、Kidney organoid
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 細胞株
- iPSC
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 断片化
- GeneWiz社のプロトコルに準拠
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp