研究 ID
hum0298-v1リリース情報
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研究題目
慢性胃炎から胃の発がんや進展に深く関与しうる遺伝子並びに非コードRNAの量的・質的異常の探索
研究概要
- 目的
- 胃がんの発生・発育進展過程における腫瘍細胞の分子異常を網羅的に探索することで発がん・がんの進展に深く関与しうるlong non-coding RNA(lncRNA)の分子異常の同定と機能解明を目的とする。さらにlncRNAと臨床病理学的因子との関連を明らかにすることで、がん予防・早期発見を目指した発がんリスク予測マーカーの開発や、治療方法の選択マーカー開発などの臨床応用を目指す。
- 研究方法
- 胃がん患者から摘出した正常胃粘膜とがん部の17個の凍結組織からDNA抽出した。胃がんで発現異常を示した17個のlncRNAと11個の胃がんがん遺伝子を対象にしたカスタムパネルを作成した。抽出したDNAからアンプリコンシークエンス用のライブラリーを作成し、カスタムパネルを用いてIon Proton sequencerによるシークエンス解析を行った。
- 対象
- 内視鏡検査を行い、胃がん患者から非がん部背景粘膜と腫瘍組織の検体を収集した。生検検体は8名の胃がん患者から採取した胃がん組織9個と正常胃粘膜8個であった。
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000467 | NGS(Amplicon-seq) |
| 制限公開(Type I) | 2025-04-10 |
提供者
- 研究代表者
- 北嶋 洋志
- 所属機関
- 札幌医科大学医学部 分子生物学講座
研究プロジェクト情報
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助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 新学術領域研究 | 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム |
|
関連論文
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