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NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間:2026年10月5日(月) 9:00 ~ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0298-v1リリース情報

最新

研究題目

慢性胃炎から胃の発がんや進展に深く関与しうる遺伝子並びに非コードRNAの量的・質的異常の探索

研究概要

目的
胃がんの発生・発育進展過程における腫瘍細胞の分子異常を網羅的に探索することで発がん・がんの進展に深く関与しうるlong non-coding RNA(lncRNA)の分子異常の同定と機能解明を目的とする。さらにlncRNAと臨床病理学的因子との関連を明らかにすることで、がん予防・早期発見を目指した発がんリスク予測マーカーの開発や、治療方法の選択マーカー開発などの臨床応用を目指す。
研究方法
胃がん患者から摘出した正常胃粘膜とがん部の17個の凍結組織からDNA抽出した。胃がんで発現異常を示した17個のlncRNAと11個の胃がんがん遺伝子を対象にしたカスタムパネルを作成した。抽出したDNAからアンプリコンシークエンス用のライブラリーを作成し、カスタムパネルを用いてIon Proton sequencerによるシークエンス解析を行った。
対象
内視鏡検査を行い、胃がん患者から非がん部背景粘膜と腫瘍組織の検体を収集した。生検検体は8名の胃がん患者から採取した胃がん組織9個と正常胃粘膜8個であった。
URL
N/A

データセット

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
JGAD000467NGS(Amplicon-seq)
  • Amplicon-seq
制限公開(Type I)2025-04-10

提供者

研究代表者
北嶋 洋志
所属機関
札幌医科大学医学部 分子生物学講座

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

科研費・助成金名研究課題名研究課題番号
科学研究費助成事業 新学術領域研究
先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
  • 16H06279

関連論文

関連論文はありません。

制限公開データの利用者一覧

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