データセット ID
JGAD000467
- データの種類
- NGS(Amplicon-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 39.9 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0298
- 公開日
- 2025-04-10
- 更新日
- 2025-04-10
- DDBJ Search
- JGAD000467 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000353 (新しいタブで開きます)
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| list.txt | 17個のlncRNAと11個の胃がんがん遺伝子 | 608 B |
解析手法
Amplicon-seq
- 材料と対象者
- 胃がん(ICD10:C16):8症例
腫瘍組織:9検体、非腫瘍組織:8検体 - 健康状態罹患
- 対象者数8 (人数)
- 対象集団日本人
- 疾患
- 胃がん (C16)
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Amplicon-seq
- 試薬キット
- Ion AmpliSeq Library Kit Plus
- 断片化
- PCR
- プラットフォーム
- Thermo Fisher Scientific Ion S5
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 200 bp