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NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0268-v1リリース情報

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最新バージョン (v2)

研究題目

がん組織を用いたネオアンチゲンスクリーニング

研究概要

目的
大腸がん組織のプロテオゲノミクスHLAリガンドーム解析による新規タイプがん抗原の探索
研究方法
RNA-seq、CAGE-seq、ならびにIso-seq解析を実施し、組織解析で同定済みの非コード領域由来新規がん抗原をコードする転写産物バリアントを探索した。
対象
ヒト大腸がん細胞株:1種類、大腸がん6症例
URL
N/A

データセット

データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
JGAD000386NGS(Iso-seq、CAGE-seq、RNA-seq)
  • Iso-seq
  • CAGE-seq
  • RNA-seq
制限公開(Type I)2021-04-09

提供者

研究代表者
金関 貴幸
所属機関
札幌医科大学 病理学第一講座/新潟大学医学部 分子病理学分野

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

科研費・助成金名研究課題名研究課題番号
日本医療研究開発機構(AMED) 次世代がん医療創生研究事業(P-CREATE)
プロテオゲノミクスによるlncRNAがん抗原を標的とした革新的免疫治療の開発
  • JP20cm0106352

関連論文

関連論文はありません。

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関国・州名研究題目データ利用期間データセット ID
浜田 道昭浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学日本RNA標的創薬データベースの構築2023-01-05 – 2027-10-31