研究 ID
hum0225-v1リリース情報
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最新バージョン (v2)研究題目
HTLV-1関連脊髄症（HAM）におけるゲノム異常及びエピゲノム異常の解析
研究概要
- 目的
- ヒトT細胞白血病ウイルス（HTLV-1）関連脊髄症（HAM）の遺伝子変異解析を通じて成人T細胞白血病の発症リスクを推定する
- 研究方法
- 次世代シークエンサーを用いたTarget capture sequencing、RNA sequencing、ATAC sequencing、single-cell Multiome（scRNA-seq、scATAC-seq）
- 対象
- 【Target capture sequencing】HAM21症例の感染細胞分画（腫瘍細胞）及び非感染細胞分画（非腫瘍細胞）
【RNA-seq】HAM13症例の末梢血由来単核球より分離した感染細胞
【ATAC-seq】HAM2症例の末梢血由来単核球より分離した感染細胞
【single-cell Multiome】HAM2症例の末梢血由来単核球と腫瘍細胞および無症候性HTLV-1感染3症例の末梢血由来単核球 - URL
- N/A
データセット
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| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000318 | NGS（Target Capture） |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 |
提供者
- 研究代表者
- 山岸 誠
- 所属機関
- 東京大学大学院新領域創成科学研究科
- 研究代表者
- 山野 嘉久
- 所属機関
- 聖マリアンナ医科大学 難病治療研究センター
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
感染症ゲノム腫瘍学分野 / 病因病態解析部門 |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
日本医療研究開発機構（AMED） 新興・再興感染症に対する革新的医薬品等開発推進研究事業 | HTLV-1関連疾患の発症リスク、進展メカニズムに関するオミックス統合解析と発症予防に資する基盤的研究 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（B） | HAMのHTLV-1感染細胞の異常形質を規定するゲノム・エピゲノム制御機構の解析 |
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日本医療研究開発機構（AMED） 難治性疾患実用化研究事業 | HAM・HTLV-1陽性難治性疾患の診療ガイドラインに資する統合的レジストリの構築によるエビデンスの創出 |
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日本医療研究開発機構（AMED） 新興・再興感染症に対する革新的医薬品等開発推進研究事業 | ゲノム情報を基盤としたHTLV-1感染症の病態形成機序の解明及び発症リスク予知アルゴリズム開発に関する総合的研究 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Mortality and risk of progression to adult T-cell leukemia/lymphoma in patients with HTLV-1-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 松岡 雅雄 | 血液・膠原病・感染症内科学講座, 熊本大学大学院生命科学研究部 | 日本 | 悪性リンパ腫、成人T細胞白血病・リンパ腫の遺伝・病理学的検討を用いた特性および経過・治療に関する後方視的観察研究 | 2022-05-18 – 2030-03-31 | |
| 浜田 道昭 | 浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05 – 2027-10-31 |