システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間：2026年10月5日(月) 9:00 ～ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0207-v1リリース情報

最新

研究題目

ヒト免疫細胞における遺伝子多型と遺伝子発現の関連解析

研究概要

目的: 滑膜線維芽細胞の炎症環境応答と関節リウマチの病態形成に対する寄与を解明する
研究方法: 関節リウマチおよび変形性関節症（コントロール）患者由来の滑膜線維芽細胞を、関節内のサイトカイン（TNF-α, IL-1β, IL-6/sIL-6R, IL-17A, IL-18, IFN-γ, IFN-α, TGF-β1, 複合炎症をシミュレートした全8種のmixture [8-mix]）で24時間刺激した。また、同一患者より末梢血リンパ球5分画（CD4陽性T細胞、CD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、単球）を分取した。各サンプルを用いて、SNPアレイ・ChIP-seq（H3K27ac・H3K4me1・H3K4me3）・Hi-C・RNA-seq解析を実施した。
対象: 関節リウマチ30症例、変形性関節症30症例
URL: N/A

データセット

カート	データセット ID	データの種類	解析手法	アクセス制限	公開日
	NHA000134	NGS（RNA-seq）による遺伝子毎のリード数カウント	RNA-seq	非制限公開	2020-01-06
	NHA000132	NGS（ChIP-seq）によるエンリッチ領域ピーク情報	ChIP-seq	非制限公開	2020-01-06
	NHA000133	NGS（Hi-C）によるループ情報	Hi-C	非制限公開	2020-01-06
	NHA000135	SNPアレイ上の変異に対する遺伝子発現量から算出したeQTL	Genotyping by array	非制限公開	2020-01-06

提供者

研究代表者: 藤尾圭志
所属機関: 東京大学大学院医学系研究科アレルギー・リウマチ学

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名	URL
ヒト免疫細胞における遺伝子多型と遺伝子発現の関連解析	N/A

助成金情報

科研費・助成金名	研究課題名	研究課題番号
科学研究費助成事業基盤研究（B）	関節リウマチ滑膜線維芽細胞における炎症メディエーター産生エピゲノム機構の解明	18H02846
科学研究費助成事業基盤研究（C）	関節リウマチ検体のトランスクリプトーム解析で同定された新規シグナルの検討	17K09972
共同研究費（武田薬品工業）	統合疾患データベースの構築とその臨床応用	N/A
共同研究費（武田薬品工業）	eQTLを基礎とした創薬標的の探索と治療法の開	N/A

関連論文

タイトル	DOI	データセット ID
Parsing multiomics landscape of activated synovial fibroblasts highlights drug targets linked to genetic risk of rheumatoid arthritis	https://doi.org/10.1136/annrheumdis-2020-218189 (新しいタブで開きます)	NHA000134 NHA000132 NHA000133 NHA000135