データセット ID
NHA000135
- データの種類
- SNPアレイ上の変異に対する遺伝子発現量から算出したeQTL
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 55.7 MB
- ファイル形式
- XLSX
- ZIP
- 研究
- hum0207
- 公開日
- 2020-01-06
- 更新日
- 2020-01-06
- Secondary ID
- hum0207.v1.eQTL.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0207.v1.eQTL.v1.zip | 55.7 MB | ||
| hum0207.v1_ | Dictionary file | 17.0 KB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- 関節リウマチ（ICD10：M05）：30症例
変形性関節症（ICD10：M06）：30症例 - 健康状態罹患
- 対象者数60 (人数)
- 疾患
- 関節リウマチ (M05)
変形性関節症 (M06) - 試料説明
- 関節リウマチ・変形性関節症患者由来の各細胞から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina HumanOmniExpressExome
- QC・フィルタリング
- SNP call rate > 0.99、HWE < 1 × 10-6、sample call rate > 0.98
- インピュテーション
- IMPUTE2
- バリアント数
- 595,693 SNVs