研究題目
乳腺腫瘍の表現型にかかわる体細胞変異および遺伝子発現異常の解析
研究概要
目的: 非浸潤性乳管がんの分子生物学的背景に基づいたリスク層別化因子の探索、および浸潤性乳管がんの転移過程の解析
研究方法: 臨床的リスク因子に基づいて非浸潤性乳管がん症例、および浸潤性乳管がんを選択し、網羅的遺伝子解析によりリスク因子との関連を検討する。 ・浸潤性乳管がん: target capture sequencing (TC) 解析、メチル化解析、空間トランスクリプトーム解析、single cell RNA sequencing (scRNA-seq) 解析、semibulk RNA-seq解析、whole genome sequencing (WGS) 解析、Enzymatic Methyl-seq (EM-seq) 解析、targeted long-read methylation sequencing (t-nanoEM) 解析を実施した。 ・非浸潤性乳がん: target capture sequencing (TC) 解析、メチル化解析、空間トランスクリプトーム解析、single cell RNA sequencing (scRNA-seq) 解析、semibulk RNA-seq解析、whole exome sequencing (Exome) 解析、single cell copy number variant (scCNV) 解析、whole genome sequencing (WGS) 解析を実施した。
対象: ヒト非浸潤性乳管がん、浸潤性乳管がん
