データセット ID
JGAD000308
- データの種類
- NGS（Target Capture）
NGS（Visium Spatial Gene Expression）、病理画像 - アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 279 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- TSV
- XLSX
- TIFF
- 研究
- hum0200
- 公開日
- 2021-04-02
- 更新日
- 2021-04-02
- DDBJ Search
- JGAD000308 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000202 (新しいタブで開きます)
解析手法
Visium 空間トランスクリプトーム + 病理画像
- 材料と対象者
- 浸潤性乳管がん（ICD10：C509）：2症例
非浸潤性乳管がん（ICD10：D051）：1症例 - 健康状態罹患
- 対象者数3 (人数)
- 疾患
- 浸潤性乳管がん
- 非浸潤性乳管がん
- 試料説明
- 腫瘍組織から抽出したRNA
- 組織乳房
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Histological image
Spatial transcriptomics - 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Visium Spatial Gene Expression
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 148 bp (28/120 PE)