システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間：2026年10月5日(月) 9:00 ～ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0195-v2リリース情報

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最新バージョン (v3)

研究題目

消化器癌における遺伝子異常についての網羅的解析

研究概要

目的: 消化器がんの病態進展に関わる遺伝子異常を明らかにすること
研究方法: 全ゲノム解析、全エクソン解析、トランスクリプトーム解析、および、targeted deep sequencing解析
対象: ・結節内結節型肝がん症例の腫瘍組織・非腫瘍組織・末梢血より単離したリンパ球
・C型肝炎ウイルス排除後に肝がんを発症した慢性肝炎/肝硬変症例、C型肝炎ウイルス陽性肝硬変/肝がん症例、および、C型肝炎ウイルス陰性肝がん症例
・胃がん症例、胃粘膜下腫瘍症例
URL: N/A

データセット

データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。

カート	データセット ID	データの種類	解析手法	アクセス制限	公開日
	JGAD000273	NGS（WGS）	WGS	制限公開（Type I）	2021-04-02
	JGAD000331	NGS（Exome、RNA-seq）	WES	制限公開（Type I）	2021-04-02
	JGAD000375	NGS（Exome、Target Capture、 RNA-seq）	WES RNA-seq Targeted DNA sequencing	制限公開（Type I）	2022-03-04
	JGAD000332	NGS（Exome、RNA-seq）	RNA-seq	制限公開（Type I）	2021-04-02
	JGAD000629	NGS（Exome）	WES	制限公開（Type I）	2022-03-04

提供者

研究代表者: 髙井淳
所属機関: 京都大学大学院医学研究科消化器内科学

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

科研費・助成金名	研究課題名	研究課題番号
科学研究費助成事業基盤研究（C）	全ゲノム解析とオルガノイド培養を用いた多段階肝発癌分子メカニズムの解明	19K08443
科学研究費助成事業基盤研究（B）	肝硬変"再生結節"の細胞クローン動態と発癌機構の解明	17H04158

関連論文

タイトル	DOI	データセット ID
Multiregional whole-genome sequencing of hepatocellular carcinoma with nodule-in-nodule appearance reveals stepwise cancer evolution	https://doi.org/10.1002/path.5533 (新しいタブで開きます)	JGAD000273
Oncogenic transcriptomic profile is sustained in the liver after the eradication of the hepatitis C virus	https://doi.org/10.1093/carcin/bgab014 (新しいタブで開きます)	JGAD000332
DNA methyltransferase 3B plays a protective role against hepatocarcinogenesis caused by chronic inflammation via maintaining mitochondrial homeostasis	https://doi.org/10.1038/s41598-020-78151-2 (新しいタブで開きます)	JGAD000332
Expansion of gastric intestinal metaplasia with copy number aberrations contributes to field cancerization	https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-21-1523 (新しいタブで開きます)	JGAD000375

制限公開データの利用者一覧

研究代表者	所属機関	国・州名	研究題目	データ利用期間	データセット ID
Jinyan Huang	Zhejiang University School of Medicine, 79 Qingchun Road, Hangzhou, 310003, Zhejiang, China. Biomedical big data center, the First Affiliated Hospital, Zhejiang University	中国	Comprehensive analysis of alternative splicing in malignant tumors	2022-03-15 – 2024-01-01	JGAD000273 JGAD000331
浜田道昭	浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学	日本	RNA標的創薬データベースの構築	2023-01-05 – 2027-10-31	JGAD000273 JGAD000331 JGAD000332