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NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間:2026年10月5日(月) 9:00 ~ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0187-v1リリース情報

このページは過去のバージョン (v1) です。最新のバージョンは v2 です。
最新バージョン (v2)

研究題目

消化器癌のゲノム・遺伝子解析とその臨床病理学的意義の解明

研究概要

目的
肝細胞がんゲノムへのウイルスゲノム挿入部位解析
研究方法
ウイルスキャプチャーシーケンス(NGS)、Exome(NGS)、RNA-seq(NGS)、DNA_methylation(Infinium450K)
対象
肝細胞がん 243+160症例
URL
N/A

データセット

データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
JGAD000277NGS(Target Capture)
  • Targeted DNA sequencing
制限公開(Type I)2020-09-28

提供者

研究代表者
油谷 浩幸
所属機関
東京大学先端科学技術研究センター

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名URL
ゲノムサイエンス分野

助成金情報

科研費・助成金名研究課題名研究課題番号
日本医療研究開発機構(AMED) 医療機器開発推進研究事業
肝臓癌の術後生存率を高め、医療費低減を可能とする人工知能・質量分析診断支援装置の治験
  • JP19hk0102049
日本医療研究開発機構(AMED) 革新的がん医療実用化研究事業
国際共同研究に資する日本人難治性がん・生活習慣病関連がん大規模統合ゲノミクス解析と国際コンソーシアムでのデータ共有による国際貢献
  • JP19ck0106265
日本医療研究開発機構(AMED) 肝炎等克服緊急対策研究事業
ウイルス性肝疾患を含む代謝関連肝がん発生の病態解明に関する研究
  • JP19fk0210040
科学研究費助成事業 基盤研究(C)
がんゲノム解析で残された微小コピー数変化の検出とその意義の解明
  • 17K07195

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
Impact of AAV2 and Hepatitis B Virus Integration Into Genome on Development of Hepatocellular Carcinoma in Patients with Prior Hepatitis B Virus Infection
Accumulation of Molecular Aberrations Distinctive to Hepatocellular Carcinoma Progression

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関国・州名研究題目データ利用期間データセット ID
河野 隆志ゲノム生物学研究分野, 国立研究開発法人国立がん研究センター研究所日本AYA(Adolescence and Young Adult)世代がんの個別化予防に資する遺伝要因の同定を目指す研究2021-12-02 – 2028-12-31
Jinyan HuangZhejiang University School of Medicine, 79 Qingchun Road, Hangzhou, 310003, Zhejiang, China. Biomedical big data center, the First Affiliated Hospital, Zhejiang University中国Comprehensive analysis of alternative splicing in malignant tumors2022-03-15 – 2024-01-01
Jian CaoJian Cao Lab, Rutgers Cancer Institute of New Jersey, Rutgers, The State University of New Jerseyアメリカ合衆国 (ニュージャージー州)Analyzing oncovirus in NBDC tumor sequencing data2023-01-12 – 2026-03-12
浜田 道昭浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学日本RNA標的創薬データベースの構築2023-01-05 – 2027-10-31