研究 ID
hum0187-v1リリース情報
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最新バージョン (v2)研究題目
消化器癌のゲノム・遺伝子解析とその臨床病理学的意義の解明
研究概要
- 目的
- 肝細胞がんゲノムへのウイルスゲノム挿入部位解析
- 研究方法
- ウイルスキャプチャーシーケンス(NGS)、Exome(NGS)、RNA-seq(NGS)、DNA_methylation(Infinium450K)
- 対象
- 肝細胞がん 243+160症例
- URL
- N/A
データセット
データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000277 | NGS(Target Capture) |
| 制限公開(Type I) | 2020-09-28 |
提供者
- 研究代表者
- 油谷 浩幸
- 所属機関
- 東京大学先端科学技術研究センター
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
ゲノムサイエンス分野 |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
日本医療研究開発機構(AMED) 医療機器開発推進研究事業 | 肝臓癌の術後生存率を高め、医療費低減を可能とする人工知能・質量分析診断支援装置の治験 |
|
日本医療研究開発機構(AMED) 革新的がん医療実用化研究事業 | 国際共同研究に資する日本人難治性がん・生活習慣病関連がん大規模統合ゲノミクス解析と国際コンソーシアムでのデータ共有による国際貢献 |
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日本医療研究開発機構(AMED) 肝炎等克服緊急対策研究事業 | ウイルス性肝疾患を含む代謝関連肝がん発生の病態解明に関する研究 |
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科学研究費助成事業 基盤研究(C) | がんゲノム解析で残された微小コピー数変化の検出とその意義の解明 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Impact of AAV2 and Hepatitis B Virus Integration Into Genome on Development of Hepatocellular Carcinoma in Patients with Prior Hepatitis B Virus Infection | ||
Accumulation of Molecular Aberrations Distinctive to Hepatocellular Carcinoma Progression |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 河野 隆志 | ゲノム生物学研究分野, 国立研究開発法人国立がん研究センター研究所 | 日本 | AYA(Adolescence and Young Adult)世代がんの個別化予防に資する遺伝要因の同定を目指す研究 | 2021-12-02 – 2028-12-31 | |
| Jinyan Huang | Zhejiang University School of Medicine, 79 Qingchun Road, Hangzhou, 310003, Zhejiang, China. Biomedical big data center, the First Affiliated Hospital, Zhejiang University | 中国 | Comprehensive analysis of alternative splicing in malignant tumors | 2022-03-15 – 2024-01-01 | |
| Jian Cao | Jian Cao Lab, Rutgers Cancer Institute of New Jersey, Rutgers, The State University of New Jersey | アメリカ合衆国 (ニュージャージー州) | Analyzing oncovirus in NBDC tumor sequencing data | 2023-01-12 – 2026-03-12 | |
| 浜田 道昭 | 浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05 – 2027-10-31 |