データセット ID
JGAD000277
- データの種類
- NGS（Target Capture）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 688 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0187
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000277 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000194 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 肝細胞がん（ICD10：C220）：243症例
腫瘍組織：243検体
非腫瘍組織：59検体 - 健康状態罹患
- 対象者数243 (人数)
- 疾患
- 肝細胞がん
- 試料説明
- 肝がんの手術摘出組織の腫瘍組織および非腫瘍組織（腫瘍組織の周辺組織）から抽出したgDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- Virus integration site（ウイルス配列と、ウイルスのヒト融合配列、および非特異的に生じるウイルス以外のヒト配列を含む）
- 試薬キット
- SureSelect Custom
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina MiSeq
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 200 bp (約)