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NBDC ヒトデータベース
JGAD000328
公開日
2021-06-04

更新日
2021-06-04

研究
hum0187

データの種類
NGS(Exome、RNA-seq)、Methylation array

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000233

解析手法

WES

材料と対象者

肝細胞がん(ICD10: C220): 160症例 腫瘍組織: 160検体 非腫瘍組織: 160検体

実験方法

Exome

プラットフォーム

Illumina [HiSeq 2500]

試料説明

腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA

ライブラリ構築

SeqCap EZ HGSC VCRome2.1 design1(42 Mb, NimbleGen)、SureSelect Human All Exon Kit V4/V5(Agilent Technologies)

断片化

超音波断片化(Covaris S2)

リードタイプ

Paired-end

リード長

100 bp

JGAデータセットAccession
総データ量

7 TB(fastq、bam)

利用ポリシー