データセット ID
JGAD000328
- データの種類
- NGS（Exome、RNA-seq）、Methylation array
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 5.7 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- BAM
- 研究
- hum0187
- 公開日
- 2021-06-04
- 更新日
- 2021-06-04
- DDBJ Search
- JGAD000328 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000233 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 肝細胞がん（ICD10：C220）：160症例
腫瘍組織：160検体
非腫瘍組織：160検体 - 健康状態罹患
- 対象者数160 (人数)
- 疾患
- 肝細胞がん
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SeqCap EZ HGSC VCRome2.1 design1
SureSelect Human All Exon - 断片化
- 超音波断片化（Covaris S2）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp