研究 ID
hum0153-v1リリース情報
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研究題目
希少腫瘍の発症・予後に関する遺伝子の網羅的解析研究
研究概要
- 目的
- 脱分化型脂肪肉腫および腱鞘巨細胞種の疾患発症・予後に関連する遺伝子の探索
- 研究方法
- 腫瘍組織および同一患者の非腫瘍組織（血液もしくは周辺正常組織）より抽出したDNA・RNAを用いたWhole Exome Sequencing（WES）、RNA-seq、ならびにTarget Capture Sequencing
- 対象
- 脱分化型脂肪肉腫 29症例
・腫瘍組織：脱分化型成分29検体、高分化型成分8検体（WES+RNA seq）
・非腫瘍組織（末梢血）：29検体（WES）
腱鞘巨細胞種 36症例
・腫瘍組織：10検体（WES）、18検体（RNA seq）、34検体（Target seq）
・非腫瘍組織：10検体（WES）、34検体（Target seq） - URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000257 | NGS（Exome、RNA-seq、Target Capture） |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000258 | NGS（Exome、RNA-seq、Target Capture） |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 |
提供者
- 研究代表者
- 松田 浩一
- 所属機関
- 東京大学 大学院新領域創成科学研究科
- 研究代表者
- 平田 真
- 所属機関
- 東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
骨軟部腫瘍ゲノムコンソーシアム | N/A |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE） | ゲノム解析による骨軟部腫瘍の多様性の解明と治療標的・バイオマーカーの探索 |
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日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE） | ゲノム解析による骨軟部腫瘍の多様性の解明と治療標的・バイオマーカーの探索 |
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日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム（P-DIRECT） | 軟部肉腫に対するゲノム解析による新規治療標的分子の探索 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（A） | 骨軟部腫瘍における診断マーカーの同定と腫瘍概念の再構築を目指した融合遺伝子の探索 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Massively parallel sequencing of tenosynovial giant cell tumors reveals novel CSF1 fusion transcripts and novel somatic CBL mutations |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Valerie Brunton | Edinburgh Cancer Research UK Centre, University of Edinburgh | イギリス | Genomic analysis of soft tissue sarcoma | 2021-07-09 – 2025-04-17 | |
| William Tapper | Human development and health, University of Southampton | イギリス | Utilising sarcoma omic information to identify disease gene networks and associated novel therapies for patients | 2022-11-14 – 2025-10-20 | |
| 浜田 道昭 | 浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05 – 2027-10-31 |