hum0153 のリリース情報
hum0153-v1
2019-09-20- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 脱分化型脂肪肉腫および腱鞘巨細胞種の腫瘍組織及び非腫瘍組織（末梢血もしくは周辺正常組織）から抽出したDNA・RNAを用いた全エクソン解析、全トランスクリプトーム解析およびターゲットキャプチャーシークエンス解析結果をfastqおよびbamファイルにて提供する。
脱分化型脂肪肉腫および同一患者の末梢血よりDNA・RNAを抽出後、Agilent SureSelect XT Human All Exon V5 + IncRNA kit（WES）、TruSeq Stranded mRNA Prep kit または TruSeq RNA Access Library Prep kit (RNA seq)にてライブラリを作成し、Illumina HiSeq 2500にて配列解読を行った。
腱鞘巨細胞種および同一患者の非腫瘍組織（周辺正常組織）よりDNA・RNAを抽出後、Agilent SureSelect Exome V5 kit（WES）、TruSeq Stranded mRNA Prep kitもしくはTruSeq RNA Access Library Prep kit (RNA seq)にてライブラリを作成しIllumina HiSeq 2500にてシークエンスを行った。Target sequenceはCBL遺伝子の全エクソン領域をPCRにて増幅後、TruSeq Nano DNA Library Prepkitにてライブラリーを作成、MiSeqにて配列解読を行った。