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2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0120-v2リリース情報

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最新バージョン (v4)

研究題目

消化器癌患者の末梢血液中における転移再発の予測因子候補に関する臨床的意義の確立

研究概要

目的: 大腸がん、胃がん、乳がんの転移再発を正確に予測するバイオマーカーの同定
研究方法: 原発巣・転移巣の切除切片（腫瘍組織および正常粘膜）から抽出したDNA/RNAを用いた全エクソームシーケンス、RNA-seq、およびT細胞のレパトア解析、ならびにメチレーションアレイおよびWhole genome bisulfite sequencing解析。治療前後で経時的に血漿サンプルを採取し、抽出した血中循環腫瘍DNAを用いたTarget Capture Sequencing解析。
対象: 原発巣切除後に肺・肝転移をきたしたstage 1、2の大腸がん、胃がん、乳がん
URL: N/A

データセット

データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。

カート	データセット ID	データの種類	解析手法	アクセス制限	公開日
	JGAD000311	NGS（Exome）	WES	制限公開（Type I）	2020-09-28
	DRA011183	NGS（Exome）	WES	非制限公開	2020-12-14
	DRA011184	NGS（RNA-seq）	RNA-seq	非制限公開	2020-12-14
	DRA011185	NGS（Target Capture）	Targeted DNA sequencing	非制限公開	2020-12-14

提供者

研究代表者: 三森功士
所属機関: 九州大学病院別府病院外科

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

科研費・助成金名	研究課題名	研究課題番号
日本医療研究開発機構（AMED）次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE）	微小環境多様性に連動する難治がんの分子遺伝学的多様性創成機構の解明と新たながん治療法・予測医療技術の開発	JP19cm0106504

関連論文

タイトル	DOI	データセット ID
Pan-cancer methylome analysis for cancer diagnosis and classification of cancer cell of origin.	https://doi.org/10.1038/s41417-021-00401-w (新しいタブで開きます)	E-GEAD-396 DRA010902

制限公開データの利用者一覧

研究代表者	所属機関	国・州名	研究題目	データ利用期間	データセット ID
白石航也	ゲノム生物学研究分野, 国立研究開発法人国立がん研究センター研究所	日本	ゲノム解析に基づく宿主並びに腫瘍における免疫応答ネットワーク機構の解明	2019-08-05 – 2029-03-31	JGAD000311 JGAD000312