データセット ID
DRA011183
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 197 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0120
- 公開日
- 2020-12-14
- 更新日
- 2020-12-12
- DDBJ Search
- DRA011183 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 大腸がん（ICD10：C189）：10症例36検体
・腫瘍組織（大腸：10検体、肝臓：9検体、肺：5検体）
・非腫瘍組織（大腸：8検体、肺：4検体） - 健康状態罹患
- 対象者数10 (人数)
- 疾患
- 大腸がん
- 試料説明
- 大腸がんの腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 組織結腸、肝臓、肺
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V5
- 断片化
- 超音波断片化 （Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp