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NBDC ヒトデータベース
JGAD000311
公開日
2020-09-28

更新日
2021-12-06

研究
hum0120

データの種類
NGS(Exome)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000221

解析手法

WES

材料と対象者

大腸がん(ICD10: C189): 10症例36検体 ・腫瘍組織(大腸: 10検体、肝臓: 9検体、肺: 5検体) ・非腫瘍組織(大腸: 8検体、肺: 4検体)

実験方法

Exome

プラットフォーム

Illumina [HiSeq 2500]

試料説明

大腸がんの腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA

ライブラリ構築

SureSelect Human ALL Exon V5

断片化

超音波断片化(Covaris)

リードタイプ

Paired-end

リード長

100 bp

JGAデータセットAccession

非腫瘍組織: JGAD000311 腫瘍組織: DRA011183

Sequence Read Archive Accession

非腫瘍組織: JGAD000311 腫瘍組織: DRA011183

総データ量

414 GB (fastq)

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