研究 ID
hum0111-v1リリース情報
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最新バージョン (v3)研究題目
胃腫瘍のゲノム・遺伝子解析とその臨床病理学的意義の解明
研究概要
- 目的
- 胃がんにおける腫瘍浸潤リンパ球の遺伝子解析
- 研究方法
- Illumina HiSeq 2000を使用したRNA-seqおよびIllumina MiSeqを使用したT/B細胞抗原受容体mRNAのターゲットシーケンシング
- 対象
- びまん性胃がん30症例（RNA-seqは腫瘍組織のみ。Amplicon-seqは腫瘍組織とその近傍の非腫瘍組織のペア）、胃がん60＋15症例（Amplicon-seq：腫瘍組織とその近傍の非腫瘍組織のペア）
- URL
- N/A
データセット
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| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000105 | NGS（RNA-seq） NGS（Amplicon-seq） |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000104 | NGS（RNA-seq） NGS（Amplicon-seq） |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 |
提供者
- 研究代表者
- 石川 俊平
- 所属機関
- 東京大学 医学系研究科 衛生学分野
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 若手研究（A） | がん浸潤リンパ球の抗原受容体次世代シーケンス ～がん免疫システムの包括的理解～ |
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日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE） | 胃癌における癌細胞と免疫細胞の統合ゲノミクス |
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日本医療研究開発機構（AMED） 革新的バイオ医薬品創出基盤技術開発事業 | 臨床腫瘍特異的なシングルドメイン抗体機能複合体の取得技術に関する研究 |
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日本医療研究開発機構（AMED） 創薬基盤推進研究事業 | ゲノム情報科学と機械学習に基づく高機能抗体のデザイン開発技術に関する研究 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Immunogenetic Profiling for Gastric Cancers Identifies Sulfated Glycosaminoglycans as Major and Functional B-cell Antigens among Human Malignancies | ||
Capturing the differences between humoral immunity in the normal and tumor environments from repertoire-seq of B-cell receptors using supervised machine learning. | ||
Focal adhesion ribonucleoprotein complex proteins are major humoral cancer antigens and targets in autoimmune diseases |
制限公開データの利用者一覧
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