データセット ID
JGAD000104
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
NGS（Amplicon-seq） - アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 69.0 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0111
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000104 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000103 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA Amplicon-seq
- 材料と対象者
- びまん性胃がん（ICD10：C16）：30症例（腫瘍組織と非腫瘍組織のペア）
- 健康状態混在
- 対象者数30 (人数)
- 疾患
- びまん性胃がん
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Amplicon-seq
- 測定対象
- TCRα、TCRβ、IgVH、IgVκ/λ遺伝子のV領域からC領域まで
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina MiSeq
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 300 bp
- 表現型データの有無
- あり